トカラ列島中之島と宝島の間に分布の境界があるとされるが、普通種ゆえに十分に検証されているとは言い難い。次種の例を鑑みればアマミチビゲンゴロウが本土で見出される可能性も考えられるだろう。チビゲンゴロウは上翅斑紋の変異が著しいが、アマミチビゲンゴロウについては情報が乏しい。本土の記録は今のところ単発で、極めてまれな在来種なのか、何らかの移動手段による侵入種なのか不明。亜属であったが現在は属として扱われている。