FDRという用語が出てくるたくさんの検定をやるシチュエーション「ほぼすべての検定が帰無仮説に従っている」とみなすなら、ボンフェロニとかFWER的なマルチプルテスティング補正をする(GWASの場合)が、対立仮説が真であるのがたくさんある(少なくともこれくらいはある)というような場合(2群の多数の遺伝子の発現差・発現比〜体系的発現解析)には、それだとうまくないeFDRはそういう経緯でマイクロアレイの体系的発現解析での利用が(ゲノム解析系では)スタート今や、FDR関連の諸ツール・パッケージはこんな感じに山ほどあるリストにはないけれど、ごく簡単にはp.adjust()があるが(こちら)...それはp値の分布に対するものたとえば、locfdrパッケージのlocfdr()関数はたくさんの統計量を放り込むと、そこに(1)正規分布を想定して(2)経験分布を推定して、そのうえで、外れている統計量がどれくらいはずれているかで珍しさを値にしてくれる全体のヒストグラムを描き、その両端について、珍しさの割合がムラサキ色にしてある。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。