構造化12月27日の記事で、互いに近い亜集団のSNPアレル頻度をfを用いてシミュレーションすることを書いた。隔離された期間のあるような亜集団間では、このシミュレーションだけではうまく行かない。HapMapプロジェクトで見られるアジア2民族(日本人と中国人)のSNPアレル頻度をコプロットすると、掲載図(オリジナルのJPGはこちら)のように正相関する群と逆相関する群に分かれる。同じ頻度であった多型がFixationしていく過程は、正相関直線(y=x直線)から逸脱していく分を表す。逆に、逆相関直線(y=1−x直線)から逸脱していく分は、一度、逆アレルに固定したあと、マイグレーションなどによりアレル頻度の混じりあいが起きたものに相当する(と思われる)。して固定されたものの混ざり合いのアレル頻度の違いを反映してくる。control手法が対象としているのは、その論理から行って、前者のFixation過程にある群のみとなることに注意を要する。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。