じ生物種で遺伝的に異なる(遺伝的多様性がある)集団が、日本各地に存在します。形態が同じため、外見では判断できず、これまで解析が困難でした。生物技研では、次世代シーケンサーを用いた環境DNA解析により、ハプロタイプを検出します。16反復の場合(弊社標準):80,000円/サンプル(税別)1stPCRを4反復、2ndPCRで4反復/反復(計16反復)8反復の場合:60,000円/サンプル(税別)1stPCRを4反復、2ndPCRで2反復/反復(計8反復)4反復の場合:45,000円/サンプル(税別)1stPCRを4反復、2ndPCRで1反復/反復(計4反復)※上記は、弊社で水サンプルのろ過から行う場合の料金です。抽出DNAを送付いただく場合は、-10,000円/サンプル、ろ過済フィルターを送付いただく場合は、-6,000円/サンプルです。0円/サンプル(税別)対象の生物種をご連絡ください。イワナとコイについては設計・合成済です。※プライマーの設計・合成が必要な場合は、プライマー合成完了後20営業日です。水サンプル(>1L)を冷蔵便で送付下さい。「サンプル情報提供用紙」を同封してください。冷蔵保管と発送が難しい場合は下記を参考にしてください。フィルター(GF/C)を用いて、ろ過を行います。↓DNA抽出(注1)フィルターに残った物質からDNAを抽出します。抽出DNAからPCR阻害物質を除去した後、DNA溶液の濃度測定を行います。領域をターゲットとして、ライブラリーを複数反復分作製します。その後、ライブラリーの濃度と品質を確認致します。MiSeqを使用してシーケンシング解析を行います。(600cycles)を使用し、2x300bpのpaired-endリードを取得します。↓データ解析usearchを用いて、得られた塩基配列を100%の条件でまとめます。すべての反復間で検出された配列をハプロタイプとして出力致します。その後、配列情報が登録されている場合は、配列比較した結果を納品致します。リアルタイムPCR解析にも使用することが可能です(追加料金が必要です)。●使用機器Illumina社の次世代シーケンサーMiSeqを使用。使用した16S全長アンプリコン解析サービスの一時休止について12.162019ステリベクスインキュベーション用ハイブリオーブン12.162019年末年始のお休み最近のブログ2020.2.13大野さん食堂10月に開始してから毎週木曜日は大野さん食堂です。予定通りミズアブ御飯を作りました。2020.2.9BSFプロジェクト年度末繁忙期でブログのネタがありません。BSFプロジェクトのネタをアップします。