土壌用DNA抽出キット土壌からDNAを抽出するキットの性能比較をしてみました。最近のはどれも優秀です。DNA抽出キットの評価を自社圃場のクロボク土壌と珈琲搾りかす堆肥で行いました。評価したキットは方法のことなる3種類です。SPINは土壌抽出用キットの世界標準的ポジションらしいです。菌相解析の結果はほとんど変わりませんでした。データは載せておりませんが、収量もほぼ同じです。クロボク土壌からのDNA抽出というと一昔前はキットによっては全然DNAがとれないものもあったようですが、今はどれも優秀ですね。珈琲搾りかす堆肥については写真の白い部分をサンプリングしてみました。教科書的には放線菌がたくさんいるという部分ですが、今回はバシラス綱に属する数種の好熱性細菌が優先していました。堆肥のバラつきはサンプリングのバラつきだと思います。堆肥については今後いろんな条件で調べていきます。なんでもかんでもアンプリコンスシーケンスとは?弊社の次世代シーケンス解析サービスの主力商品であるアンプリコンシーケンス解析はリーズナブルかつ非常に強力なツールです。簡単に言うと、どんな物であってもその中に入っているDNAを決定し、どのような生物が入っているのかを明らかにできます。こんなことは他の技術ではできません。弊社ではアンプリコンシーケンスの素晴らしさをしっていただくために、いろんな物をアンプリコンシーケンスして、その結果をwebで公開していきます。真面目な実験技術に関する内容もありますが遊びネタもあります。某テレビ局のホ●マでっかTVくらいに受け止めていただけたら幸いです。-2ツバメの食事ブログ2020.2.13大野さん食堂10月に開始してから毎週木曜日は大野さん食堂です。予定通りミズアブ御飯を作りました。