Assemblies(ペイパー))第2段階の情報の適切な納め方のコンセンサスについては、グラフベースのそれがよさそうと言うところまでは得られているらしい。Cruzのこれとか、グラフ理論的なこれとかなのでしょうかさて。locus唯一これだ、という登録配列と並列しておくハプロイドシークエンス。1本以上の配列ファイルの連結(Scafold)(オーバーラップ・ギャップを含む)として登録する。groupとするAssemblyたくさんの配列ファイルを集めて、その並び方を定めた一塊のこと。うまくアラインメントされていない配列もそれに含まれることももちろんある。lociも含めたものになる。locusはもう一つのunit。Patch配列情報はどんどん追加されるので、修正したくなることがある。バージョンアップをせずに、ひとまず、パッチを当てて修正する、という段階を踏む。patch)との2種類がある。File複数の配列登録ファイルを紡いでコンティグ・スキャフォルド・染色体配列を作り上げるが、その紡ぎ方を書いたファイルContig配列登録ファイルを紡いで1つらなりにしたシークエンス。ギャップがないものをcontigと呼び、ギャップがあるものをスキャフォルドと言うが、区別を曖昧にして使うこともあるComponent配列登録ファイルに基づく、生配列Join配列と配列とののりしろ重なり部分Scaffoldスキャフォルド配列。複数配列を紡ぎつつ、ギャップがあるもの。locusとして登録したり、と言う作業はヒトによるcurationが必要。そのCuration作業をIssueとしてピックアップする。Issueは決着したら、それを新規リリースに反映する必要がある。(問題解決後、何になったか。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。