EMディプロイドのコピー数多型が染色体別に決定されたとして、観測サンプルのコピー数別アレル数を確定的に算出し、それをもとに期待度数を算出し、観測度数と比較してカイ自乗検定をする場合と、ディプロイドの保有コピー総数のみが観測されて、それに基づいて、EMでコピー数アレル頻度を推定し、それから期待度数を算出し、その値に基づいて、同様にカイ自乗検定を行う場合とで、その検定P値がどのくらい一致するかを、シミュレーションデータで調べてみる。アレルタイプが2つだけのときは、両者は一致するが、アレルタイプ数が増えるにつれ、一致度は下がる。アレルタイプ数3のときの図でもっともよくわかるように、両者の統計量には、片側にある限界を定める関係線が存在する。アレルタイプ数が増えると、その限界線の許容範囲も拡大していることがわかる。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。