相対式2面2線の地上ホームを有するいずみ野線の駅である。橋上駅舎化され、1番線は下り、2番線は上りが使用する。いずみ野線は相鉄本線二俣川から分岐して湘南台までを結ぶ路線で、1976年4月8日に二俣川からいずみ野までが開業、弥生台もこの時同時に開業した。1990年4月4日にはいずみ中央まで延伸、1999年3月10日に湘南台まで延伸して全通した。計画段階の駅名は「新橋町」だったが、駅周辺の開発時に弥生時代の土器が出土したことから「弥生台」となった。