次に膠原病の原因についてみていきましょう。←【図11】なぜ自分の体を守るはずの免疫機構の一部が自分の体を攻撃してくるという誤りを生じるのでしょうか。残念ながら、その原因はよくわかってはいません。発病のきっかけのようなものがあるのだろうと考えられています。←【図12】その一つ目は遺伝因子です。ある家族を考えてみたとき、お母さんが膠原病の場合の方が、その子供さんが膠原病を発症する可能性がほんの少しだけ高いことがわかっています。子供さんが膠原病にならない場合のほうが圧倒的に多く、膠原病は遺伝病ではありません。←【図13】もし遺伝病であれば同じ遺伝子を持っていれば必ず発病するはずですが、膠原病の場合、例えば一卵性の双子でも二人ともが発病するとは限りません。膠原病自体は遺伝しないということです。