SPARQLthon42]で検討した連携のための準備を開始した。Numberを入れ、GlyTouCanもPDBjへのリンクを入れる計画。SPARQLthon42]で検討した連携のための準備を開始した。Numberを入れ、GlyTouCanもPDBjへのリンクを入れる計画。id、SUGAR分子座標を抽出し、SDFileを作成(結合距離再計算、アノマー位アミノ酸残基抽出、アミド結合確認などの処理を実行)する検討中。還元末端の単糖の酸素原子(O1)が取得できない(PDBに原子がない?)、化学結合が正しく形成されない、何故か抽出できないなどの問題がある。GlyTouCan:ID”のTSV形式を公開する。現在、118088件位処理済み、11395件(NMR)、1319IDSUGAR有り、53879SUGAR分子?〜エラーがあるのでログで確認する予定。id、SUGAR分子座標を抽出し、SDFileを作成(結合距離再計算、アノマー位アミノ酸残基抽出、アミド結合確認などの処理を実行)する検討中。還元末端の単糖の酸素原子(O1)が取得できない(PDBに原子がない?)、化学結合が正しく形成されない、何故か抽出できないなどの問題がある。GlyTouCan:ID”のTSV形式を公開する。SUGAR有り、53879SUGAR分子?〜エラーがあるのでログで確認する予定。下記日程で開催したいと思います。(成松)PDBjとGlyTouCanの連携(山田)SPARQLthon42で検討した連携のための準備を開始した。Numberを入れ、GlyTouCanもPDBjへのリンクを入れる計画。id、SUGAR分子座標を抽出し、SDFileを作成(結合距離再計算、アノマー位アミノ酸残基抽出、アミド結合確認などの処理を実行)する検討中。還元末端の単糖の酸素原子(O1)が取得できない(PDBに原子がない?)、化学結合が正しく形成されない、何故か抽出できないなどの問題がある。GlyTouCan:ID”のTSV形式を公開する。SUGAR有り、53879SUGAR分子?〜エラーがあるのでログで確認する予定。データ整備(小寺)酵素反応のTransformation(基質・生成物ペア)と語彙の関係約25,000個をRDF化。特別ページ印刷用バージョンこの版への固定リンクプライバシー・ポリシーTogoWikiについて。