次世代シーケンサ解析ある公開されているexomeデータのfastqファイルをダウンロードして解析しようとしたところ、うまくいきませんでした。最初は何が何だかわからず困っていたのですが、fastqファイルを確認するとID行の書式がよく見かけるものと違いました。例として、最初の1リードはこうなっていました。@HWI-ST7001130:252:C258HACXX:5:1101:1723:2158¥R1ACCTGTTGCTTCCCCTGGGACTGAAGGCAGAAGTGACTCCCGAAATTCTCTTTCTGGACTCAGAAGGAAACCAAAGCAATCGATGACACCGCATCNNNNAC+?7?=D;BDD4C?AEEC;313AEECE?+<CC;1?DD????BD:?60BB<4)B8)=)8==AC)7=))=CC;=?;??>6.;((-(,5(>>>A='3&05####+(このfastqの書式はBWAでは受け付けられず、エラーとなります(他のソフトでは未確認です)。このID行(1行目)には以下の問題があります。「/」または半角スペースならBWAが動きました。「/」のときは「1」「2」、半角スペースのときは「1」「2」または「R1」「R2」のどちらでも動きました。この場合は、「¥R1」「¥R2」を以下のコマンドで「/1」「/2」に書き換えて対処しました。[sample_new]_R2.fastq.gz([sample]、[sample_new]は任意のサンプル名をご使用ください)もし同じようなデータがありましたらご参考までに。(1)memberid:amelieffid:Fuku-Iid:miwa-tid:hr-kid:fujinamisid:miya-yid:kubo-mid:ta-yid:yama_toid:yokokozuarchivesはてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。