解析するツールについてご紹介しました。sizeの入力が必要です。sizeは不明な場合が多いです。sizeを計算してくれるツールを調べていたところ、PicardsのCollectInsertSizeMetricsがありました。sizeのヒストグラムを描画してくれるツールです。様々なパラメータがありますが、必須のパラメータは3つだけです。ヒストグラムを出力するファイルコマンドは以下のようになります(ファイル名・バージョンは任意です)。sizeに関する統計量が書かれています。HISTOGRAM_FILEで指定したファイル(ここではhist.pdf)には、下図のようなヒストグラムが生成します。sizeが213.9bpと計算されました。bpだと判断しました。詳細については公式のマニュアル(こちら)をご参照ください。(後)SomaticSniperについての続きです。mapping前回は、次世代シーケンスデータを用いて構造多型を検出するツ...2010-05-28Rを使って図を描こう5今日は、研究対象の集団の特性を見ていきたいと思います。(1)memberid:amelieffid:Fuku-Iid:miwa-tid:hr-kid:fujinamisid:miya-yid:kubo-mid:ta-yid:yama_toid:yokokozuarchivesはてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。