DNAを基にした自然なDNA合成を百万単位の小孔(ZMW)内で同時に行うことでデータを取得します。このSMRT®テクノロジーがPacBio®システムを支える基盤技術です。■長いリード長:出力される数十kbものリードは、ゲノムアセンブリや完全長転写産物のシークエンスに最適です。■高いコンセンサス精度:シークエンスデータには決まったパターンによるエラーが含まれず、結果としてサンガーシークエンス並みの精度(99.999%以上、QV50)を得ることができます。■均一なカバレッジ:他の技術のようにGC含量に左右されず、シークエンス全体にわたって均一なデータカバレッジを得ることができます。DNA分子からは、高精度(99%)で比類ない長さのシークエンスデータを得ることができます。■エピジェネティクス情報を同時に解析:PCR不要のライブラリ調製法により温存された塩基修飾パターンを、シークエンス時に直接読み取ることができます(Sequelシステム)。先進の研究現場に新たな知見をもたらすために、正確で完全なシークエンスデータを得ることは担保されるべき点です。これ以上、正確さやリード長で妥協する必要はありません。SMRTシークエンスは2つのシークエンスモードであなたの研究推進に貢献します。sequencing)モードがもたらすHiFiリードは、一塩基変異から構造変異まで多岐にわたる変異タイプの検出において、高い解像度をもたらします。2.0で調製したヒト由来ライブラリ(20kbでサイズ選択)を、SequelIIシステム(ケミストリー2.0、ソフトウェア8.0、30時間ムービー)で解析したデータです。PCR増幅を必要としないためGC含有量に依存しない均一なカバレッジが得られるグラフはヒト由来20kbのHiFiライブラリにおけるGC含有量ウインドウ毎の平均カバレッジを示します。(SequelIIシステムを使用。read)モードとして扱うことで、複雑なゲノムにさえも高度なアセンブリ結果をもたらします。2.0で調製したE.coli由来ライブラリ(35kbでサイズ選択)を、SequelIIシステム(ケミストリー2.0、ソフトウェア8.0、15時間ムービー)で解析したデータです。システマチックエラーが無くQ50(精度99.999%)以上を達成SequelIIシステム(ケミストリー2.0、ソフトウェア8.0)で解析したハプロイドの微生物ゲノムのデータです。全ゲノムショットガン法によるゲノム配列決定を試みたとき、ショートリードシークエンサーではゲノム中に散在する反復配列等がアセンブリ結果から特徴的に抜け落ちてしまい、バクテリアサイズのゲノムであっても完成させることは困難でした。SMRTシークエンス(HiFiリード・ロングリード)では、複雑なゲノム構造の配列決定を行うことが可能です。複雑なゲノム構造を明らかにしたり、ATリッチな配列を最少のバイアスで読み取ることも可能です。対して検証を行いました。15xのHiFiリードにより、SNVsは網羅性・正確性ともに99%以上の検出率でした。indelやSVsでも、95%以上と高い検出率を誇っています。SMRTシークエンスから得られるロングリードは、スプライシングバリアントの異なる発現遺伝子を一気にシークエンスできるので、より細かい遺伝子の分類・識別に効果を発揮します。PacBioは、cDNA全体を読むことができるほど、長いリードを出力する。ロングリードで解析すると、そこに確かに存在している1本の分子を、そのままの形でとらえることができる。HLAのタイピングなどシス/トランスのSNPをきちんとフェージングしたい場合に、クローニングなしのサンガーシークエンスあるいはショートリードシークエンスでは、その情報が失われてしまいます。シス/トランスの情報を保持したまま一気に読みきることが可能です。装置構成・ソフトウェア■本体:ベースコールサーバを含みます。Analysis:直観的に扱えるGUIをお試しください。コマンドラインによる解析も可能です。DevNet:SMRTシークエンスのために開発された各種コミュニティツールをご紹介します。PACBIO認証サービスプロバイダーPacBio®認証サービスプロバイダーは、SMRTシークエンスを用いたサービスを展開する受託サービス機関です。厳格な技術トレーニングとベストプラクティスを学んだパートナーが、高品質な結果を提供します。SequelIIシステムタカラバイオ株式会社SequelIIシステムのスケールメリットを活かせば,大型で複雑なゲノムの解析を経済的に行うことができます。ヒトゲノムの染色体構造解析やSNV解析、非モデル生物のゲノム配列構築、16SrRNAやHLAのような高頻度多型領域の全長PCR産物解析に用いることが可能です。詳細はお問い合わせください。小回りの利くSequelシステムでは、1Gb以下のゲノム解析やアンプリコンシークエンスを効率よく行うことができます。DNAのアプリケーションにも対応しています。塩基修飾の検出は6mAと4mCが可能です。詳細はお問い合わせください。Biosciences社が提供するDNAシークエンサーおよび試薬は研究目的のみに使用できます。診断目的およびその手続き上での使用はできません。シークエンサーあるいはPacBio®シークエンサー向けの、ユニークなライブラリ調製用キットを提供しています。ユニークなライブラリ調製技術により、様々なタイプのDNAから効率よくシークエンスデータの取得が可能です。他社キットではあきらめていた解析にも、可能性が広がります。Genomics社が提供する、ゲノムアセンブリ完全受託サービスです。お預かりしたサンプル(組織、DNA)から数百kbのシカゴライブラリを作成し、シークエンスします。ショットガンシークエンスのコンティグ配列と、シカゴライブラリの配列データを使い、数メガ塩基に及ぶスキャフォルド配列を,解析結果として納品します。Reserved.特定商取引法に基づく表記プライバシー・ポリシー-->。