NGSは、次世代シーケンスデータの解析、マネジメント、図示化ができる統合的なツールです。MeDIP-Seqに対応しています。スタンダードな生物種のシーケンスアノテーションを簡単にダウンロードでき、その他の生物種についてもアノテーションを作成することが可能です。Controlとフィルタリングで品質の低いデータを解析から除外します。GeneOntology、GSEA、Pathway解析などで生物学的解釈を調べられるので、単なるリード情報を実験のゴールに結び付けることができます。変化、スプライシング解析、新規遺伝子の発見。見るSNP、InDel、コピーナンバー、構造変化の検出。SIFT、Polyphen2、dbSNPやCOSMICのアノテーションを使用した予測。サイト、影響のあった遺伝子、ヒストン修飾の同定。有意なモチーフ検出など。ターゲットmRNAの予測。見る違いのあるメチル化領域、メチル化シトシンの検出、メチレーション効果の研究。見るCpGカウントとメチル化依存性の推定、異なるメチル化領域の検出とトランスクリプトモデルへのアノテーション付け。Transformに基づいた、独自のアラインナーが搭載されています。RNAのリードとDNAリード(ChIP-Seq、DNA-Seq、MeDIP-Seq)と、RNAのリード(スプライス、スプライス無しどちらも可)のアラインメントができます。NGSのアラインナーはロングリード、ショートリードどちらにも対応しています。ギャップやミスマッチを許容し、シングルエンド、ペアエンドどちらもアライン可能です。※Methyl-Seqデータのアラインメントはできません。Paperを見る遺伝子レベル、エキソンレベル、トランスクリプトレベルでの発現値。アラインメント前後のQC、低品質のリードのフィルター、アダプターの除去。Browserクリックしますと拡大します。ゲノム上にどのようなリードがあるかを可視化。アノテーションデータを重ね合わせることが可能です。複数の異なる領域を同時に見たり、ズームしたり、ブックマークしたりもできます。クリックしますと拡大します。既知のPathwayを使用したPathway解析、NLP由来のネットワーク作成、GeneOntology、GSEA、GSA解析。クリックしますと拡大します。LTSまで)※最新バージョンを新規インストールする際の対応OSです。OSアップデートについてはsupport@digital-biology.co.jpまでお問い合わせ下さい。※必要なディスクスペース、CPU、メモリは下記に依存します。詳しくは、下記を表記の上support@digital-biology.co.jpまでお問い合わせ下さい。DNAを基にした自然なDNA合成を百万単位の小孔(ZMW)内で同時に行うことでデータを取得します。システムを支える基盤技術です。Reserved.特定商取引法に基づく表記プライバシー・ポリシ。