當初の伽藍は応仁の亂でほとんど焼失し、現在の諸建造物はそれ以降建立のものである。大門から參道を下って正面の仏殿は、寛文8年(1668)徳川四代將軍家綱によって再建され、現在伽藍の多くはこの時整備されている。仏殿は一重もこし付入母屋造り本瓦葺き、唐様建築の代表作で、國の重要文化財である。建物を移築改裝したもので、仏殿と同時代に現位置へ移された。開山俊律師が熱願された舎利を、弟子の湛海律師が安貞2年(1228)に宋朝より將來し遷座した。現在同時に將來された韋駄天像・月蓋(がつがい)長者像(共に重文)とともに內陣に奉祀されている。毎年、將來の日とされる10月8日(舊暦9月8日)には舎利會法要が営まれ多くの參拝者でにぎわう。東に鎮まる陵墓は月輪陵(つきのわみさぎ)と呼ばれる。四條天皇をはじめ後水尾天皇から仁孝天皇までの25陵、5灰塚、9墓が営まれている。ここに鎮まる方々の御葬儀は泉山長老が御導師をお勤め申しあげ、御陵もすべて仏式の御石塔でお祀りされている。