2013に参加させていただいております。_■Bioconductorは、バイオ解析関連のRパッケージを集めたサイトです。750個以上(2013年12月時点)の有用なパッケージが登録されています。複数の遺伝子の特徴の傾向を見たい時に、GeneOntologyで機能や局在を調べることがよくあります。BioconductorのbiomaRtパッケージを使って、遺伝子にGeneOntologyのアノテーションをつけることができます。今回は、お酒の強さに関係があるといわれる「ADH1B」「ALDH2」遺伝子に対応するGeneOntologyIDを調べてみましょう。biomaRtパッケージをインストールします。>source('http://bioconductor.org/biocLite.R')>biocLite('biomaRt')「ADH1B」「ALDH2」に対応するGeneOntologyIDを取得します。mart=ens)取得したデータを見てみましょう。>edit(data)←クリックで拡大します予想通り、アルコール代謝に関連ありそうなGeneOntologyIDがヒットしています。次回、これらのGeneOntologyIDがどのような関係にあるか、BioconductorのRamiGOパッケージを用いて描画してみたいと思います。生命科学の研究に携わっているR初心者の方にRの基本的な操作方法を学んでいただく、アメリエフ・バイオインフォマティクス・スクール「R基礎」の開催日程はこちらです。(1)memberid:amelieffid:Fuku-Iid:miwa-tid:hr-kid:fujinamisid:miya-yid:kubo-mid:ta-yid:yama_toid:yokokozuarchivesはてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。