このゲノム編集技術を応用して哺乳類ゲノムの発現調節メカニズムの解明とその進化に関わるゲノム領域の機能解析も進めています。高次ゲノム構造にも注目し、多種生物間ゲノム配列分子進化解析により抽出した哺乳類獲得形質に関わる配列をゲノム編集技術で機能解析し、哺乳類発生の進化のメカニズムを明らかにしようとしています。最近の成果として、トリプルCRISPR法の開発があります。従来のゲノム編集マウス作製では、初代のマウスはモザイクとなってしまうため表現型解析が出来ませんでした。私たちはガイドRNAの設計を見直し、一遺伝子内の3箇所を同時にターゲットとすることでほぼ100%標的遺伝子ノックアウトを実現、交配を必要とすることなく初代マウスでの表現型解析を可能にしました。