2018.10.31目次MRIConvertの使用感MRIConvert出力ファイルの種類MRIConvertの使用感MRIConvertは、NIfTIに変換したいDICOMファイルの入ったフォルダを選択して、実行するだけで、自動的にフォルダー管理してくれます。通常のMRIの撮像では、位置の撮像・T1強調画像・fMRI(T2*強調画像)など複数のDICOMファイルが出力され、フォルダーで管理されていると思います。MRIConvertを使えば、複数の撮像(DICOM)でも、自動的にその撮像にあった名前のフォルダーが作成され、とても管理しやすい状態で、出力されます。MRIConvert追加したファイルを自動的にフォルダー管理してくれるので、変換後のフォルダがわかりやすいです。f-MRIデータとT1などで、自動的に分けてくれます。下のリンクからMRIConvertをダウンロード&インストールしてください。https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvertインストールが完了したら、下のファイルを起動します。files」をクリックします。変換したいDICOMファイルを選択します。今回は、出力形式を「NIfTI」にします。注意optionsをクリックしてください。file]にチェックが付いているか確認してください。チェックが入ってないと、Analyze形式(.hdrと.imgの拡張子)になってしまいます。その他4Dなどの設定も出来ます。下の画像はmac版ですが、windowsも変わりません。NIfTIかNIfTIではないでしょうか。Analyzeは、Analyze形式なので、.hdrと.imgの2つのファイルが作成されてしまうので、あまりお勧めはしません。.niiの拡張子を持つNIfTIが一般的なようです。その他のフォーマットは特別なことがない限り使用しないでしょう。7.5BrainVoyager私は、NIfTIを使用しています。SPM12の解析手順の記録しようと思います。SPMは、MATLAB上で動作するので、当たり前ですが、MATLABが必須となります。Regでは、複数のMRI画像を並べて、確認することができます。結局、FreeFurferはUbuntu環境では動作しませんでした。AnalysisMRIConvertを使ってNIfTI変換Summaryβshort某大学院M1データ解析を勉強しています。プログラミングPythonC++ホーム検索トップサイドバーSummaryβshort某大学院M1データ解析を勉強しています。ネットワーク分析アーカイブ2020年2月12020年1月112019年12月62019年11月22019年10月52019年9月82019年8月102019年7月42019年6月72019年5月202019年4月82019年3月112019年2月122019年1月142018年12月132018年11月202018年10月242018年9月232018年8月162018年7月112018年6月182018年5月6タイトルとURLをコピーしました。