つの統計モデルのそれぞれから計算される尤度を比較することにより検定を行う方法であり、一般化線形モデルでよく使われる検定の一つである。この考え方は発現変動遺伝子の検出にも適用できる。群」の発現量の差の検定に応用できるのかについて見ていく。表すことのできる統計モデルをいう。等しくなるように変換を行う関数である。ように、分布が決まればリンク関数の形もほぼ決まる。ついて考えなくてよい。以下、説明を簡略するためにリンク関数を省略して書く。デザイン行列あるいは計画行列と呼ばれ、実験群や処理群の情報などが行列で記述される。パラメーターベクトルとよばれ、モデル化する際に想定されるパラメーターからなるベクトルである。ここで二群間二因子比較データをモデル化する。つのパラメーターで表すことができる。含まれているため、これを行列の形で表すと以下のようになる。