リードカウントデータから発現変動遺伝子を検出するときによく利用されている有名なパッケージである。種類の方法が実装されている。呼ばれている方法である。一つは一般化線形モデルの尤度比検定を利用する方法である。後者は二群間比較のみならず複雑なモデルにも適用できる方法となっている。いずれの方法においても以下の手順で行う。バージョンが異なると、解析結果も少し異なってくる。ついて解析例を紹介する。なしの場合)サンプルデータサンプルデータは、カウントデータが負の二項分布に従うように乱数を生成して作成した。個であり、その発現パターンは以下のように設定した。