データフレーム型を要求するため、これらをデータフレームにまとめる。統計量などを計算する。比較するように指定する。正常細胞とがの比較で差が出るような遺伝子として生成している。遺伝子が上位にランキングされている。解析結果をファイルに書き出す。対応ありの二群間比較においては、患者間の比較に興味がなく、正常細胞とがん細胞のような比較が目的である。一般化線形モデルによりこれを解析を行う方法について説明する。つのモデルに差があるかどうかを検定する方法である。リードカウントデータをモデル化することによって、尤度比検定を発現変動遺伝子の検出に応用できる。少ないパラメーターをしか含まない。含まれていないパラメーターの効果を調べることができる。機能を調べることに似ている。