二代目クラリスクレイスの辿った結末を目にし、帰還したアッシュ。アフィンは、【若人】(アプレンティス)と出会ってから・・・。報復のため、アークスシップを襲撃する【若人】(アプレンティス)。クラリッサを手放した二代目クラリスクレイスを、【若人】(アプレンティス)は残酷な手段で追い詰める。アッシュは二代目クラリスクレイスを救うため・・・。一覧シャオに呼び出されたアッシュは、残されたシオンの記録から「マトイに関するデータ」と「十年前のある時期の事象の記録」が・・・。一覧ダークファルス【敗者】(ルーサー)としての姿を解放したルーサーは、怒りのままにアッシュに襲い掛かる。圧倒的な力を持つ【敗者】(ルーサー)に・・・。六芒均衡の協力を得て、マトイと共にシオンの元へ向かうアッシュ。シオンを救うため先を急ぐ彼らの前に・・・。一覧シオンに導かれ、マザーシップの中心部を目指す、アッシュとマトイ。その行く手を阻もうとする・・・。管制より全アークスに船団への帰投命令が下る。混乱するアークスたちの間では、とある噂が広まりつつあった。動揺するアッシュの前に姿を現したシオンは・・・。一覧ルーサーの野望を阻止するため、シャオたちに協力することを決めたアッシュ。行われた実験の痕跡を追う中、シャオはルーサーの目的と、その鍵となる・・・。一覧アフィンと共に、惑星ウォパルの調査任務に就いたアッシュ。現地で再会したエコーは・・・。一覧アフィンと共に、惑星ウォパルの調査任務に就いたアッシュ。現地で再会したエコーは・・・。一覧ナベリウスでゼノを探すアッシュは、廃墟に住み着いた老人との対話でアークスを喰らうと噂される「暴走龍」の真実に近付くことになる。撃破したはずの【巨躯】(エルダー)が生存していたと知り、思い悩むアッシュ。そんな中、ゼノを探すためにナベリウスに降りたアークスが暴走龍に襲われ・・・。【巨躯】(エルダー)の強襲により、アークスたちは大きな犠牲を払うこととなった。ウルクを探そうとするテオドール、気丈に振る舞いながらも、ゼノを案じるエコー。ゲッテムハルトを失い・・・。【巨躯】(エルダー)が放ったファルス・アームが次々とアークスシップを襲い、混乱する船内。アークスたちは船団と宇宙を守るため・・・。一覧メディカルセンターに向かう中、ゼノ、エコーと再会したアッシュ。マトイと合流し、安堵したのも束の間・・・。テミス」がダーカーに襲撃された――十年ぶりに船内に現れたダーカーに、戸惑いを隠せないまま出撃するアークスたち。一覧アークスシップで束の間の休息を楽しむアッシュたちは、アークスを目指す少女ウルクと出会う。彼女はアッシュたちの同期の中に・・・。惑星ナベリウスにて任務中、アークス最強の六人『六芒均衡』の一人であるという少女と出会ったアッシュは・・・。多くの犠牲を出した新人訓練から、無事に生還したアッシュとアフィン。アークスとして初の任務に就くことになった二人は、新人訓練で助けた謎の少女、マトイと共に再びナベリウスに降り立つ。指揮官のコハナと共に・・・。