これに対し胚葉が3つとも形成されるものを三胚葉性の動物という。脊椎動物などではこの後神経管が形成される神経胚期へと進む。ニワトリでは、外胚葉に神経板という領域ができ、それが胚の内側に丸まる事で神経管ができ、さらに直下に脊索が形成される[34]。神経管の前方には前脳、中脳、後脳という3つの膨らみが形成され、これらが将来脳になる[35]。脊椎動物などでは、組織や器官を形成するため、胚細胞が特定の機能を持った細胞に変化する(細胞分化)[36]。この際、基本的な細胞機能の維持に必要な遺伝子(ハウスキーピング遺伝子)の機能は残しつつ、特定の機能に必要な遺伝子を新たに発現し、逆に分化後には不必要になる遺伝子をDNAメチル化により不活性化する[36]。脊索の両側の沿軸中胚葉から体節が形成され、体節と隣接した外側の中間中胚葉からは腎節が形成される[37]。形成され[37]、腎節からは腎臓や生殖腺が形成される[37]。中間中胚葉のさらに外側には予定心臓中胚葉という、将来心臓関連の組織になる部分があり、これは壁側中胚葉と臓側中胚葉に転移する[38]。心臓は生命の維持に不可欠なので、発生の早い段階で中胚葉から形成される[40]。予定心臓中胚葉は中胚葉の正中線を隔てた両側に2つ存在するが、これら2つは移動して胚の前方で合流して心臓を形成する[40]。脊椎動物では外胚葉と中胚葉の相互作用で四肢が形成される[41]。ヒトの手足は水鳥と違い、指の間に水かきがないが、これはアポトーシスの作用で水かき部分の細胞を「自殺」させている為である[42]。動物の起源については、単細胞生物の襟鞭毛虫が集まって多細胞化する事で海綿動物のような動物になっていったと考えられる[43]。rDNAに基づいた解析等により、動物は襟鞭毛虫類を姉妹群に持つ単系統な群であることが示されており、ヘッケルの説が有力とされている[43]。先カンブリア時代30億年以上前に地球上初めての生物が誕生したと考えられており、真核生物の最古の化石は21億年前の地層から発見されている[44]。動物の起源は10~12億年前まで遡れると分子系統解析と古生物学的証拠から推定されている[45]。2012年現在、動物のものかもしれない最古の化石は2012年にナミビアの7億6000万年前の地層で発見されたオタヴィア(Otavia)という0.3~5mm程度のかりんとうのような形をした小さな殻で、海綿動物だとすると表面に空いている多数の細孔から微小なプランクトンを濾過摂食したものと考えられる[46]。Formationという化石が発見されており、これも初期の海綿動物ではないかと考えられている[47]エディアカラ生物群の一つであるディッキンソニア次に古いと思われる多細胞生物の化石は6億2千万年~5億4千2百万年前のエディアカラ生物群である[48]。仲間であるという解釈もあれば、一部には現生動物とは全く違う動物群とする解釈もあるなど見解が定まっていない[48]。explosion、5億7500万年前)[49][50]、カンブリア爆発の頃にその多くは姿を消した(カンブリア中期の5億1000万年前~5億年前まで生き残っていたものはまれである)。現在の動物門のほとんどをしめる30余りの動物門が生じたとされる(カンブリア爆発)[51]。分子系統解析によればこれらの動物門は最古の化石より10億年以上遡ると推定されている[51]。カンブリア紀に突然生物が増えたように見えるのは、この時期に化石に残りやすい生物種が増えたからに過ぎない[52][53][54][55]。カンブリア爆発は2000万年[56][57]から2500万年[58][59]続いた。オルドビス紀にはカンブリア紀までに登場した動物門が大きく適応放散している[51]。オルドビス紀末に大量絶滅(O-S境界)があったが[51]、無顎類(顎の無い脊椎動物)は生き残り、シルル紀に多様化し、顎のある脊椎動物も登場した[51]。デボン紀には硬骨魚類が多様化し、石炭紀には両生類が繁栄、ペルム紀には爬虫類が繁栄した[51]。シルル紀には最古の陸上動物の化石である節足動物多足類が登場し、デボン紀に節足動物が多様化、石炭紀には翅を持つ昆虫類が登場した[51]。中生代トリケラトプスの化石ペルム紀末には地球史上最大の大量絶滅(P-T境界)が起こり、中生代三畳紀には海洋生物が大量に絶滅[51]。哺乳類が登場した[51]。ジュラ紀には恐竜が繁栄し、鳥類も登場した[51]。軟体動物の殻を破るカニ類や硬骨魚類が進化し、これに対抗して厚い殻をもつれ合い軟体動物が進化した(中生代の海洋変革)[51]。白亜紀までには現生の昆虫類のほとんどが登場[51]。白亜紀末には巨大隕石の衝突による大量絶滅がおこる(K-Pg境界)[51]。適応放散し、現在と同様の動物相が形成される[51]。新生代の後半にあたる第四紀には人類も出現した。化石動物について、上記の分類される現存動物門のいずれにも属さないとして、新たな動物門が提唱されることがある。これらについては、うたかたのごとく提唱されては消えていくものも少なくないが、主なもののみ挙げる。Fedonkin,1985トリブラキディウムなどが属する。三放射対称の体制をもつ。Fedonkin,1985ディッキンソニア、ヨルギアなどのヴェンド生物が属する。左右相互に対称する体制をもつ。2001ウェツリコラなどが属する。その後は脊索動物とされ、その1亜門(古虫動物亜門)になる[60]。1938アイシュアイア、ハルキゲニアなどが属する。汎節足動物であり、該当する動物門[61]のそれぞれの初期脇道系統(ステムグループ)を含んだ側系統群であると考えられる[62][63]。下記は動物界の系統樹を門レベルまで描いたものである[64]。いずれであるかにより分類されていた。rRNA遺伝子の解析により、体腔の違いは進化とは関係ない事が判明し、上述の意味での後口動物は単系統でない事が示されたので、いくつかの動物門を新口動物から外し(後述)、前口動物に移した[72]。4つは左右相称動物に含まれない動物門である。前左右相称動物に属する動物は体の左右相称性(=左右対称性)がない。定まっていないる[75]。海綿動物は相称性がなく胚葉がないなど最も単純なボディープランを持つ[75]。海綿動物の細胞は化するものの、組織を形成することはなく[87]、複雑な器官をもたない[88]。刺胞動物と有櫛動物の体は放射相称性を持ち、唯一の腔所である胃腔の開口は口と肛門を兼ねる[89]。これらの動物門の細胞は組織に分化しているものの、器官を形成していない[90]。中胚葉が形成されない二胚葉性の動物であるとされるが、細胞性である間充織を中胚葉とみなし、ヒドロ虫綱以外の刺胞動物と全ての有櫛動物を三胚葉性とみなす事も多い[91]。刺胞動物は手に刺胞があり、物理的または化学的刺激により毒を含む刺糸を発射する[89]。単体と群体がある[89]。漂泳性(クラゲ型)と付着性(ポリプ型)という生活様式の異なる2つの型を持ち[89]、両者は上下を逆さにした形[89]。それに対し有櫛動物は全てクラゲ型[92]。二放射相称で透明な脆弱な体を持つ[92]。参照4つの門を除いた全ての動物門が左右相称動物である。左右相称動物は完全な三胚葉性で[94]、体が左右相称(=左右対称)[94]。祖先的な左右相称動物は珍無腸動物である[95][96][97]。左右相称動物のボディプランは、前方(運動のとき体の進む方向)と後方の区別、腹側と背側の区別がある傾向があり、したがって左側と右側の区別も可能である[98][99]。運動のとき体の前方へと進むので、進行方向にあるものを識別する感覚器や餌を食べる口が前方に集まる傾向にある(頭化という)。多くの左右相称動物は環状筋と縦走筋のペアを持つので[99]、ミミズのような体が柔らかい動物では水力学的骨格(英語版)の蠕動により動く事ができる[100]。多くの左右相称動物には繊毛で泳ぐことができる幼生の時期がある。以上の特徴は例外も多い。3つに分類がなされている[101]。糸形動物はカイチュウ、ギョウチュウ、アニサキスなどからなる線形動物門とハリガネムシ目と遊線虫目からなる類線形動物門により構成される。例として寄生生物を多くあげたが、自由生活を送る線形動物もいる[104]。有棘動物は冠棘という主に頭部に数列有る環状に並ぶ棘を持つという共有性質から名付けられた[105]。花状器官という感覚器を持つことと、頭部が反転可能な事、偽体腔を持つ事も共有性質である[105][106]。動物界最大の門である節足動物を含む系統群である。汎節足動物は体節を持つ事を特徴とする[107]。環形動物も体節を持つため、歴史的には環形動物も節足動物の近縁であると考えられていたが、分子系統解析により、近縁性が否定されたため、環形動物は汎節足動物ではなく冠輪動物に分類されている[107]。六脚類:広義の昆虫類。内顎類(トビムシ、カマアシムシ、コムシなど)、外顎類(狭義の昆虫類)に分かれる[109]。汎節足動物は節足動物門以外には緩歩動物門と有爪動物門を含む。絶滅した群まで範囲を広げると葉足動物と呼ばれる古生物をも含む。緩歩動物門に属する動物はクマムシと呼ばれる動物であり[110]、ゆっくり歩く事からその名が名付けられた。陸上に生息する種では、クリプトビオシスという極限状態に耐えられる休眠状態になる事が知られている[110]。有爪動物門に属する動物はカギムシと呼ばれ、現生種は真有爪目のみ[111]。有爪動物のそれぞれの最後の共通祖先を含んだ側系統群であると考えられる[62][63][112]。多くの葉足動物は一見で現生の有爪動物らしい外見をもち[63]、かつては原始的な有爪動物として分類された[113][63]。その後、節足動物と緩歩動物らしい形質をもつ葉足動物の発見に至り[114][115][116][117][118]、葉足動物と有爪動物の多くの共通点は、両者の系統的類縁関係を反映していない、汎節足動物の共有原始形質と見なされるようになった[112]。巻き貝の胚の螺旋卵割このグレードに属するほとんど(全てではない[119])が螺旋卵割を行うという形質をもつため[120][121]、螺旋動物もしくは螺旋卵割動物(Spiralia)と呼ばれる。いう3つの系統を含む。前者2つを合わせたものを扁平動物と呼ぶこともあるが[65]、本稿の系統樹に用いた参考文献[122]では採用されていない。担輪動物はトロコフォア型の幼生を持ち[123]、ミミズやゴカイを含む環形動物門、貝類やタコやイカを含む軟体動物門などからなる。asininaのトロコフォア冠輪動物に属する軟体動物門は節足動物門についで大きい門で、三胚葉性[124]。真体腔を持つ(退化的である事が多い)[124]。体節がない[124]。骨格がなく軟体[124]。一般的には体は頭部、内蔵塊、足からなり[124]、外套膜が内蔵塊を覆っている[124]。外套膜が分泌した石灰質の貝殻を持つ事が多い[124]。有殻類は綱レベルの単系統性は多くの場合保証されているが[125]、綱レベルの系統関係は2018年現在一致を見ていない[125]。原口が口になる動物(上図)と原口が肛門になる動物(下図)。歴史的にはこれが前口動物と後口動物を分ける基準であった。含み[65]、新口動物とも呼ばれる。2018年現在、棘皮動物と半索動物が姉妹群をなすという説が大勢を締めており[64][127]、これら2つをあわせて水腔動物もしくは歩帯動物という。後口動物は歴史的には胚にできた原口が口になる前口動物に対し、原口が口にならず新たに口が開く動物として定義されていたが[128]、1990年代に分子系統解析が始まると、この歴史的な意味での後口動物は単系統にならない事が示されたので、毛顎動物や有鬚動物などが後口動物から前口動物へと移され、前述の門のみが後口動物として残された[129]。毛顎動物や有鬚動物のような原口が口にならない動物も前口動物に含まれている事になるので注意が必要である。共通性を持つ[127]。棘皮動物は、成体五放射相称[144]、三胚葉性[144]、海にのみ生息し、自由生活[144]。僅かな種をのぞき底生性[144]。雌雄異体が多い[144]。消化管は口から肛門につながるが、一部の種では肛門が退化[144]。ウミユリ綱、ヒトデ綱、クモヒトデ綱、ナマコ綱、ウニ綱からなり[144]、これらのうちウミユリ綱が最も祖先的だと考えられている[144]。頭索動物:一生、全体長に渡って脊索を持つ。尾索動物:一生ないし一時期に尾部に脊索を持つ。ホヤ綱、オタマボヤ綱、タリア綱(ヒカリボヤ、ウミタル、サルパなど)からなる。シリーズ〉、2010年4月28日。シリーズ〉、2011年9月21日。978-4785358495。シリーズ〉、2015年2月21日。978-4785358624。30講〔環境編〕3〉、2013年5月25日、初版。2018年9月28日。978-4621303092。螺旋は冠輪動物と呼ばれる事もある。中生動物門は直泳動物門と二胚動物門に分けられている[65]。中生動物門は原生動物から後生動物に進化する過程であると過去には見られていたが、2010年現在では寄生生活により退化した後生動物であると見られている[66]。扁形動物門に分類されていた珍渦虫と無腸動物を新たな門として立てたもの。2018年7月18日閲覧。『デジタル大辞泉』の解説。2018年7月11日閲覧。2018年2月25日閲覧。2007年8月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。2007年9月30日閲覧。2007年9月30日閲覧。増殖と生体システム』学会出版センター、1993年、初版。4-7622-6737-6。武村政春『DNAを操る分子たち』技術評論社、2012年、初版第1刷。978-4-7741-4998-1。増殖と生体システム』学会出版センター、1993年、初版。4-7622-6737-6。井出利憲『細胞の運命IV細胞の老化』サイエンス社、2006年、初版。4-7819-1127-7。1995年、第2版第6刷。4-8079-0340-3。黒岩常祥『ミトコンドリアはどこからきたか』日本放送出版、2000年6月30日第1刷発行。4140018879。2014年9月1日閲覧。2018年2月28日閲覧。2018年7月20日閲覧。2016年2月3日閲覧。pp.78-79より。2018年10月28日閲覧。2009年6月28日閲覧。pp.68-69より。2017年9月2日閲覧。2014年8月11日閲覧。2011年6月18日閲覧。2011年6月18日閲覧。pp.174-175.関連項目ウィキメディア・コモンズには、動物に関連するカテゴリがあります。