新人A&Rとして就職した主人公・澄空つばさ。仕掛けられた罠のように、入社早々、アイドルユニット「B-PROJECT」の担当に命じられる。無数の光が色とりどりにきらめき、浮遊している無重力の空間——「知識の箱」。そこには幾つもの世界があり、幾度の時間があり、幾多もの人がいた。デュアルとドロシーの2人はそこで敵と戦っていた。敵、それは世界を侵食する存在——ウイルス。ウイルスに汚されてしまった世界は消去しなくてはいけない。それが彼女たちの役割、彼女たちの仕事。あるときデュアルとドロシーは新たなウイルスの出現を感知する。そこにはウイルスに襲われている少女がいた。少女を救った2人は、静かに彼女の目覚めを待つ。少女は何者か——どこから来て、どこへ行くのか。その少女は「リモ」と名乗ると、ひとことつぶやいた——。「お花畑に、帰らないと......」。シャンズ・アカデミイ〉は存在していた。騒動へと発展していく――。