MassBaseは代謝産物(メタボライト)に関するマススペクトラルタグ(MST)のアーカイブです。植物の生体サンプルやその代謝産物から得られた生のクロマトグラムデータおよびクロマトグラムデータを解析したテキストデータを収録しています。MassBankやKNApSAcKのような他のデータベースと組み合わせて興味のある代謝を理解するだけでなく、代謝物質ピークを抽出し、代謝物質をアノテイトするパイプライン・ソフトウェアを開発するためにも活用できます。全てのデータセットがダウンロード可能です。