乗り入れており、乗り換えに便利な駅です。乗り換え専用の通路や改札が用意されており、四ツ谷や飯田橋と比べて乗り換えやすいと思います。中央・総武線の乗り換え方を紹介します。全体像をつかむため、構内図を載せておきます。東京メトロHPより南北線・有楽町線からJRへの乗り換えに係るポイントは、JRのりかえ専用改札までたどり着くことです。都営新宿線も同様です。いえ、市ケ谷駅の乗り換えはあまり難しくないので、別に全体像をつかまなくても大丈夫です。南北線からJRのりかえ専用改札まで南北線のホーム5号車付近から、九段方面改札に向かう階段・エスカレーターを上ります。前方の通路を直進します。左手にある、中央・総武線や有楽町線方面の通路に入ります。動く歩道を直進します。階段・エスカレーターを上ります。その先を右前方に進みます。JRのりかえ専用改札です。JRのりかえ専用改札の手前のところを左に曲がると、都営新宿線ののりかえ改札に行けます。有楽町線からJRのりかえ専用改札まで続いて、有楽町線からJRのりかえ専用改札までの行き方を紹介します。ホーム8号車付近で下車し、階段・エスカレーターを上ります。(ここを左に曲がると、都営新宿線の連絡改札です。)JRのりかえ専用改札です。JRのりかえ専用改札からJRホームまでJRのりかえ専用改札を通過したら、道なりに進みます。