以下のようなヒトのChainSelfの図を描いてみたいと思います。今回は「(1)データファイル用意」を行います。類似領域を探したデータです。データはUCSCから入手可能です。hgdownloadから、chainSelf.txt.gzをダウンロードして解凍します。ChainSelfのように、ゲノム上の2領域間をつなぐデータはCircosではLinkトラックという形式で表します。染色体2、スタート位置2、エンド位置2だけ抜き出したファイルを作成します。Circosの表記に合わせ、染色体名中のchrをhsに置換します。全データだと数が多いため、スコアが10Mより大きい箇所にだけ絞り込みました。以下のコマンドを実行すると、上記の変換を行うことができます。data.txtこれでデータファイルの作成は完了です。次回は、Circosの設定ファイルを作成したいと思います。(1)memberid:amelieffid:Fuku-Iid:miwa-tid:hr-kid:fujinamisid:miya-yid:kubo-mid:ta-yid:yama_toid:yokokozuarchivesはてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。