環境質リスク管理研究室のブログスマートフォン用の表示で見る環境質リスク管理研究室のブログこの広告は、90日以上更新していないブログに表示しています。curve)を描く必要に迫られた、Rで描けって言われたけど、Rを触ったことほぼないし...という学部生・M1向けの記事です。relationships.「そもそもRって何?」という方は、私が作った資料で恐縮ですが↓のスライドを見てみてください。この記事で紹介している教科書もおススメです。Rで用量応答関係の解析をしているウェブサイトは、日本語でもいくつか見つかります(こちらとかこちら)。致死毒性試験の結果を解析した例が見当たらなかったので、この記事を作成することにしました。One)、および上記の日本語で書かれたdrcについてのサイトを参考にしました。drcパッケージで図を描く」だけ読んでいただければOKです。使用するデータ下の図のような実験をおこなった場合を考えましょう。10匹のヨコエビをビーカーに入れ、96時間後の致死数をカウントします。下の表が実験結果だとします。表のDeadは致死個体の数、Totalはビーカーに入れた総数、Concは曝露濃度をそれぞれ示しています。対照区Controlは便宜的に0と書いておきます。Jan)研究室のようす昨年の9月から本研究室に来ていたSaretさんの送別会をおこないました。言っても、来年度も研究室に来てくれるそうです。incongruensとは貝のような殻に包まれた甲殻類の1種で、湖などの底を動き回る生物です。post.底質などの固体汚染試料の毒性を調べるためにも使用されています。ISO(国際標準化機構)によって試験法が定められています。14371).そのISOの標準法は、6日間の致死と成長阻害で毒性を評価します。繁殖能や長期の致死など、他の指標も用いてみたいな、ということで本研究室では慢性試験法の開発と理論的な検討をおこなってきました。それが今回の2本の論文です。WordClouds.com.有害物質に曝露していない状態で、初回産卵日や産卵数、孵化率などの指標のばらつきを調べた論文です。それらのばらつきの大きさをもとに、慢性試験の指標としての適用可能性を議論しています。discussed.慢性試験の適用例として、道路塵埃を用いた試験をおこなっています。incongruensの卵は、100日以上も孵化しない場合があります。毎回の毒性試験でそれほど長い間孵化を観察するのは、とても面倒です...。指標とするときに孵化を何日間観察すれば良いのかを、個体群増加率の観点から議論しています。incongruens.孵化の遅い個体は、個体群増加率(カイミジンコの総数の増加率)への寄与が小さいから、無視しても大丈夫じゃない?という発想に基づいて、試験開始から数えて50日程度の孵化さえ見ておけば個体群増加率的に意味のある試験結果になる、と結論付けてます。この論文で対象にしたデータは非常に限られているので、日付の数字だけを鵜呑みにするのは危険です。ちなみにこの論文は、卒業生のT君の卒論時の実験データを基にしています。Winter)研究室のようすこんばんは。このブログでは初登場になります。↑このメンバーに加えて、B4が2人いるので総勢17人。僕が入ってからのこの一年では最大勢力になっております。研究室ミーティングの際、輪講室が狭く感じますが笑、賑やかでとても良いことだと思います。関東は絶賛台風接近中で嵐が吹き荒れておりますが(?)、皆さん頑張っていきましょう。(conference)ICUD!お久しぶりです、柳原です。研究発表を行いました。pollutionに関する発表も多かったです。次回は3年後、メルボルンとのことです!チェコといえばチェコ=プラハ=美しい街並み、というイメージですが天気や時間に恵まれず良い写真が撮れなかったため、もぐらのクルテクを紹介して終わります。町中でクルテクを見かけました。右:空港)さて、新学期もはじまり来週から研究室ミーティングも始動します。department~研究・実験こんにちは、日置です。最近、グラフ理論とそれを用いたネットワーク分析に興味を持ってます。遊びで、都市工学科から公表された学術論文の引用・共著関係を対象に、ネットワーク分析をおこなってみました。これが意外と、都市工での研究の歴史を知るのに適した良い分析結果かもしれません。Scienceから取得しました。同姓同名の別著者がいる場合は、手作業で除外しました(この作業が一番面倒)。Science.この記事のタイトルに東大都市工と書きましたが、もうお分かりのように都市工の環境系のみ対象にしています。計画系お目当ての方、ごめんなさい。この人選なのか、なぜあの先生が入ってないんだ、とツッコミはあるかとは思いますが、なにとぞお許しを...。一応、長く都市工で論文を出されている先生方を選んだつもりです。都市工所属の期間が短い方を対象にすると別の所属時の論文が入ってしまって、都市工の歴史を探るという今回の趣旨からずれてしまうので。あと、都市工設立時の文献は英語論文が主流じゃないっぽいので、英語論文がこの分野でも主流になってから(1980年以降?)の情報を対象にしたという事情もあります。department.肝心のネットワーク分析手法ですが、CitNetExplorerとVOSViewerを用いました。どちらも論文情報のネットワーク関係をおこなう専用のフリーソフトです。詳しくはググってください。結果その1:引用-被引用関係さっそく結果を見てみましょう。全496論文から100論文を示します。丸一つ一つが論文を示しており、その中の文字は第一著者の名前です。丸の色は、各論文が属するクラスターを示しています(この場合、全9クラスター)。縦軸は出版年で、下の行くほど新しくなっています。papers.これでは分かりにくいので、各クラスターごとに詳しく見てみましょう。論文数が一番多かった下のクラスターです。research.ウイルス関係のクラスターですね。中でも良く引用されている論文がKatayamaら(2002)です。海水中ウイルスの濃縮法を確立した論文ということで、その手法が後の論文に多く引用されているようです。中心ではないグループでも、山本研(左側)・滝沢研(右側)の論文がこのクラスター内に含まれている、あるいはこのクラスターの論文を引用していますね。※各論文に関するコメントは、アブスト・タイトルのみを読んだ私の感想なのであまりあてにしないでください。間違っていたらご指摘いただけると幸いです。department~Tweet広告を非表示にするもっと読むコメントを書く2017-08-29ヨコエビのお引越し研究・実験こんにちは。オーストラリアの少年がヨコエビに噛まれたとか、いやあの犯人はヨコエビではないとか、水深8000mの深海に降ろした観測装置にヨコエビが集まってきたとか、近頃なにかと話題のヨコエビですが、本研究室でも飼育しています。ago.飼育槽を入れていたインキュベータが壊れてしまったため、新しいインキュベータを購入して飼育槽を移し替えました。!!!!中々大変な作業でしたね...。ヨコエビグループの皆さん、お疲れさまでした~。21:05ヨコエビのお引越しTweet広告を非表示にするもっと読むコメントを書く次のページ本ブログについて本ブログは研究室所属の学生によって運営されています。記載内容は研究室の公式見解ではありません。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。