0.37高度近交化系のうち、GSPとGSN/1は54個のマイクロサテライトマーカーのほとんど全てが、1つの対立遺伝子に固定されている。ブラックミノルカや、長期閉鎖系の(およそ40年間、閉鎖集団で維持している)白色レグホーンGや褐色レグホーンも上記2系統に続いて、高い近交度を示している。ベトナムに由来するチャボや沖縄の在来鶏であるチャーンは、東南アジアからオセアニアに広がったハプログループDタイプを持っていた。Anim.)ファヨウミ由来の4系統、ヨーロッパ原産の系統、そしてアジア原産の系統に分けられた。CALは白色ワイアンドットと名古屋種の交雑系統であるため、ヨーロッパグループとアジアグループの中間に位置している。日本のニワトリであるチャボやエヒメジドリ、白烏骨鶏が互いに近縁であることなどから、この系統樹は各品種の作出の歴史を良く表していると考えられる。TGニワトリ(pLSi/ΔAeGFP-TGニワトリ)は遺伝的には白色レグホーンM/Oと近縁である。系統固有のアリルが見つかったマイクロサテライトDNAマーカーのリストキメラ作成時に、どちらの系統由来の細胞か、などの判別用に用いることができる。bpの誤差が生じるが、判別は可能である。NBRP-Chicken/Quail。