nmを超える対象をEVsとして扱い、EVアレイの~20%に、EVsが吸着していることを見出した。exomere)が選択的に吸着される傾向が見られ、今後、EVs懸濁液の流量、ナノスポットのサイズなどの実験条件と、検出ナノスポットのサイズおよび特性との相関関係の分析を進める必要がある。2019-10-24.これまでに深層学習によるCRISPRシステムのオンターゲット活性モデル構築が試みられてきたが、北京理工大学の研究チームは今回、ヒト細胞に替えて、深層学習により微生物ゲノムを対象とするsgRNAのオンターゲット活性モデルを構築した。CeepCas9およびTSAMと性能を比較し、11種類のデータセットのうち9種類について他を凌ぐ結果となった。原核生物と真核生物の差異をもたらす特性パラメータ、オフターゲット効果およびsgRNAシーケンスの特徴も考慮に入れることで、オンターゲット活性の予測精度が向上することも示した。2019-10-22.CRISPR/Cas9は、ショウジョウバエを含むモデル生物の遺伝子ノックアウトと遺伝子置換に広く利用されている。モデル生物の中で、マウス、酵母、線虫、およびゼブラフィッシュでは、CRISPR/Cas9によって部位特異的に転座や逆位といった部位特異的な染色体再編成が実現されていた。ショウジョウバエの部位特異的な染色体再編成にはこれまで、Flp/FRTシステムを介した組換えが利用されてきた。この技術はDrosDel欠失系統のコレクションの作出にも利用されているが、トランスポゾンP因子によるFRTの挿入がランダムに発生することから、染色体の再編成や欠失を設計するにあたり、予めゲノムの構造や挿入の向きを知っておく必要がある。Waterlooの研究チームは今回、self-selectingスクリーニング系を構築することでCas9と一対のsgRNAsにより、ショウジョウバエの部位特異的な染色体再編成が可能なことを、初めて示した。inversion)を帯びたショウジョウバエ系統を利用して構築した。このautosynapticのオスと野生型のメスの子孫は、挟動原体逆位の染色体乗り換へにより重複染色体が生成され異数性が過剰になり、致死となる。formのオス系統と交配し、致死性を免れた子孫を解析した。(breakpoint)が修復されていたことを確認した。CRISPRシステムのCascade複合体を形成している。2019-10-29公開待ち)。2から引用した下図左右を参照)。これまでの報告と今回の構造情報から、Cascade複合体の形成とサイズはcrRNAに依存することが示唆された。(H&E染色)が施されたサンプルの組織病理画像に元にした時代を経て、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームおよびプロテオームの分子データが加わることで、グレードの判定と予後判定がより精密になり、また、この部分の自動化が進んてきた。PC-CHiP)としてbioRxivに投稿した。はじめに、TCGAから、ゲノム、トランスクリプトームならびに臨床・予後のデータ・情報を伴っているH&E染色凍結組織の画像17,396例を抽出した。このデータセットは28種類の腫瘍組織と14種類の正常組織を網羅するに至った。1-a引用下図参照)。