科学忍者隊の創設者にして司令官を務める天才科学者。「もうひとつのガッチャマンの世界」での南部は宇宙からの侵略者である「ギャラクター」によって科学忍者隊を失い、力に固執するようになったため、渋谷で見つかったエネルギー「ネクサス」を兵器転用し、ギャラクターを殲滅した。そのうえ、ネクサスの軍事利用さえも目論んだところを阻止しようとした(その世界の)健をも殺害したため、ジョーに命を狙われている。南部博士に接触した政府の女性関係者。