おいて、「ウイルス」プログラムと、それに対抗する「ワクチン」プログラムが登場している[6]。ウイルスではなく、動的に活動するワームについては、1975年のジョン・ブラナー『衝撃波を乗り切れ』に言及がある。発表した研究論文中といわれている[7]。Warsという対戦型のコンピュータゲームにまでさかのぼる。DarwinはPDP-1上で動作する仮想機械上で、ターゲットを上書きすることで勝利する、疑似アセンブリコード同士を競わせるプログラムであり、当初は生命の定義や人工生命の可能性についての研究—自身を複製できるものが生命なのか、生命が存在するために最低限必要なことはなにか(捕食対象の識別、あるいは自己と他者の認識や自己防衛とは何か)—を研究するための“仮想環境と生態系”として研究者に利用されていた。プラットフォームの更新による仮想機械や実行環境の整備、という工程を短絡させる形で現在の、『ネイティブなソフトウェア』としてのウイルスにその流れが引き継がれることになった[8]。現在ある形での最初のウイルスがどれであるかについては諸説ある。1970年代にはCreeperと呼ばれるワームがARPANET上で確認されていた。IIにのみ感染するものであった[9]。PCに感染する初のウイルスといわれている。日本では1988年、パソコン通信を介してウイルスに感染したものが最初とされる。Clonerをはじめ、1980年代初期のウイルスは単に自らのコピーを複製し、フロッピーディスクなどを媒介としてコンピュータ間に感染するだけで、時にメッセージを表示して利用者を驚かせる程度の無害なものが多かった(FATを吹っ飛ばすなど凶悪なものも、無かったわけでもない)。ものが広くはびこるようになり、現実的な被害をもたらす原因になりはじめる。worm(これは名前の通り、ウイルスではなくワーム)が稼動しはじめたばかりのインターネットを通して被害を広げた件と、1992年3月6日にMichelangeloウイルスが感染者のデータを一斉に破壊した件について、危険なコンピュータプログラムによる現実的な脅威として、マスコミ等は大きく報道した。1991年の湾岸戦争において、アメリカ軍は空爆に先立ちイラク軍のネットワークにウイルスを侵入させて防空システムを麻痺させている[10]。1999年には電子メールの添付ファイルによって感染する初のウイルスMelissaがつくられ、感染力が飛躍的に増大した。Redが登場、同年にはウェブサイトを閲覧するだけで感染するNimdaも作成され、爆発的に広がった。Toolkitがリリースされている。今日では、単なる愉快犯的ウイルスから、クレジットカード番号などの個人情報を引き出して悪用するものまで、数万種のウイルスが存在していると言われる。2004年の予測では、アンチウイルスソフトウェアを含めたコンピュータセキュリティの市場規模は2008年には全世界で数十億ドルに達するものと予測された[11]。