古い時代の天皇の寿命が異常に長いことから、『日本書紀』の年次は古くから疑問視されてきた。明治時代に那珂通世が、神武天皇の即位を紀元前660年に当たる辛酉(かのととり、しんゆう)の年を起点として紀年を立てているのは、中国の讖緯(陰陽五行説にもとづく予言・占い)に基づくという説を提唱した。合千三百廿年」から一元60年、二十一元1260年を一蔀とし、そのはじめの辛酉の年に王朝交代という革命が起こるとするいわゆる緯書での辛酉革命の思想[8]によるという。この思想で考えると斑鳩の地に都を置いた推古天皇9年(601年)の辛酉の年より二十一元遡った辛酉の年を第一蔀のはじめの年とし、日本の紀元を第一の革命と想定して、神武の即位をこの年に当てたとされる。この那珂による紀年論は、定説となっている[9][10]。詳細は「紀年論」を参照(補注:160219現在作成中となっている段階)日本書紀の紀年がどのように構成されているか明らかにしようとする試みが紀年論で、様々な説がある[11][12]。廿一元(60×21=1260年)爲一蔀」を前提にして推古天皇9年(601年)の辛酉の年を割り出しており、この前提は「書紀」の著者たちの見解と合っているかもしれないし、違っているかもしれない。飯山説では、那珂による紀年論60×21=1260年で割り出した起源(紀元前六六〇年から1260年ののち、推古天皇9年(601年)の辛酉の年)に対する考え方をそのまま利用しながら、オリジナルの鄭玄の1320年を援用して661年辛酉の年を割り出している。前提(鄭玄の1320年を「書紀」の著者たちが使ったに違いないという推定)に答え自体が含まれていることになり、数学的には、正しい導出方法とは言いがたい。1320年を採用)を持ってきていることは否めない。