染色体のDNAは、2本の高分子が対になっていて、2重らせん構造をしています。対を作っているのは、アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)の核酸塩基とよばれるものです。水の水素結合は結構でたらめですが、核酸塩基の水素結合は決まった組み合わせで作られます。アデニンはチミンと、グアニンはシトシンと図のような水素結合しています。1つの種の中で塩基配列がよく似ていること、種形成以前に進化的に近い関係であった。パラログ(paralog):遺伝子重複で生まれた類似遺伝子で、同一ではないが、類似の機能を持っているタンパクの遺伝子。異なる種の間で塩基配列がよく似ていること。オルソログ(ortholog):共通の先祖遺伝子から垂直に伝えられ(通常の遺伝)、異なる種で同じ機能を示すタンパクの遺伝子。相同性、種の内部、種間でも共通の進化的起源を示唆する類似性。ホモログ(homolog):相同性を示す配列をもったもの。され、維管束植物に対して感染性を持つもの。生体内で棒状の構造をとると考えられる。プラスミドのようにそのゲノム上にタンパク質をコードすることもない。