以下の点が変更され、全体的にクリアが容易となっている。解説文中の呪文の詳細はドラゴンクエストシリーズの呪文体系を参照。ムーンブルクの王女の呪文に蘇生の呪文「ザオリク」が追加、その代わり「トラマナ」が削除され、「アバカム」を習得するレベルが、王女の全呪文の中で最後に変更となった(ちなみに、オリジナル版は「パルプンテ」が最後に習得)。「ベギラマ」「ベホイミ」「スクルト」「ルカナン」の各呪文の威力の強化(ただし「ルカナン」は対象が敵全体→敵1グループに変更)FC版に比べSFC版では「バギ」が不安定、弱化気味となった。『I』の「ホイミ」「ベホイミ」・『II』の「トラマナ」の消費MPが低減され、トラマナの仕様が溶岩や毒の沼地にも有効になったほか、有効期間もパーティー全員がダメージゾーンを出るまでに変更(旧作ではパーティーの先頭キャラが出るまで)された。仲間の蘇生時にHPが最大値まで回復するようになった。戦闘中にプレイヤー側が死者の蘇生を可能になった(旧作ではHPが1にしかならず、戦闘中は敵のみ蘇生可能だった)。キャラクターが一度に持てるアイテム数が1人あたり最大10個に変更され、『I』でも後の作品と同様に装備品がアイテム欄に含まれる。『I』の「ほのおのつるぎ」の特殊効果の追加、『II』のサマルトリアの王子の装備可能武器に「ロトのつるぎ」「ひかりのつるぎ」「はかいのつるぎ」が追加。旧作には存在しなかった店の追加(リムルダールの道具屋、サマルトリアの武器防具屋)。『II』のルプガナでのセーブ機能の追加。FC版ではルプガナで復活の呪文を聞くことができず、ムーンペタ以降のセーブポイントはかなり遠いラダトームまでお預けの形になっていた。「ロンダルキアへの洞窟」の落とし穴が、一度落ちた場所はそれ以降目視で回避可能になった。「ロンダルキアのほこら」の神官がHP・MP全回復の他に死者の蘇生も行うようになり、蘇生のために下界まで行く(教会または「せかいじゅのは」入手)必要が無くなった。『II』の「メタルスライム」「はぐれメタル」の硬度が大幅に強化。「会心の一撃」や「パルプンテ」の特殊効果以外ではまずダメージを与えることが出来なくなった。「ハーゴンの神殿」の中ボス3体(アトラス、バズズ、ベリアル)は、一度倒すと二度と出現しなくなった。同神殿の全てのボス(ラストボス含む)のダメージ演出が変更された(旧作では白くフラッシュするものだったが、通常モンスターと同様の点滅になった)。『II』のラストボスの使用呪文から、完全回復の「ベホマ」が削除。その代わりにHPが大幅に増加し、守備力調整の「スクルト」「ルカナン」が使用呪文に追加。最大値が65535ゴールドから99999ゴールドに増加した。