国鉄分割民営化に伴い、東日本旅客鉄道の駅となる。当駅に1往復のみ停車していた特急『はつかり』が当駅は無停車となり、当駅に停車する優等列車はなくなる。八戸駅間がIGRいわて銀河鉄道へ移管され、IGRいわて銀河鉄道の管轄駅となる。同時に好摩駅長が廃止され、IGR盛岡駅長管理となる。一環として、駅舎が橋上化され、駅の東西を結ぶ自由通路「ふれあい通路」が開設された。ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、合計2面3線のホームを持つ地上駅である。互いのホームは跨線橋で連絡している。日中のみ駅員が配置される直営駅となっている。JR時代は駅長配置の管理駅でみどりの窓口設置駅であったため全国のJR券が購入できていたがいわて銀河鉄道線開業後JR券(指定券など)は購入できなくなった。17:00)、IGRの自動券売機がある。JRの乗車券は自動券売機での購入となる(好摩からの花輪線と盛岡接続の東北本線主要駅までに限る。オレンジカードは使用不可)。花輪線の回数券・定期券の取扱はない。このため、好摩発着も含む花輪線完結の定期券、回数券を購入するには、みどりの窓口がある二つ隣の大更駅(東大更駅は無人駅)か、いわて沼宮内駅まで行く必要がある。一環として、2009年5月15日より駅舎の建て替え工事が行われ、2011年5月15日に新たな橋上駅舎での営業を開始するとともに、駅の東西を結ぶ自由通路「ふれあい通路」や東口(バス・タクシー乗り場)が新設された。当駅間もJRの乗務員(運転士・車掌)が担当している。IGRの2017年度1日平均乗降人員は1,901人である。これはJR線通過客を含む人員であり、実際の利用者はこれより少ない。