清水寺のご本尊は、本堂内内陣の須弥壇(しゅみだん)上の厨子内におわします、十一面(四十二臂)千手観音像です。この御本尊は厨子内の秘仏であり、原則33年に一度しかお目にかかることはできません。直近では平成20年(西暦2008年)の9月1日から11月30日までの期間、御開帳が行われました。特別の御開帳がありました。次の御開帳は2041年になる予定です。厨子とは仏像などを安置するための仏具のことです。「清水寺式(せいすいじしき)」と呼ばれる特殊なお姿をされており、42本の腕の内、二対の腕で頭上に如来仏を抱いておられます。平泉の中尊寺にも清水式の千手観音像が祀られていますが、清水寺のご本尊の方がexquisite(繊細で綺麗みたいな意味)なお姿です。千本の腕と眼により、我々の苦悩に応じた方法で遍く救ってくださるという絶大なご利益があります。御本尊の高さは約173センチ、檜の寄木造で玉眼を有します。寄木造とは、平安時代から始まった方法で、仏像の主要部分を一本の木からではなく、複数の木を使って作る方法です。玉眼とは、仏像内部から水晶を埋め込み眼を表現する技法で、鎌倉時代から用いられ始めました。