RDocは拡張子によってファイルをどう処理すべきかを決めます。あるファイルはCのソースとして処理されます。リを再帰的に走査します。コマンドラインから以下のようにして起動します。[name...]ファイルをパースし、そこに含まれている情報を集め、出力します。全ファイルに渡るクロスリファレンスが生成できます。トリならば、その中を走査します。ファイルを処理します。なります(デフォルトではパブリックメソッドのみです)。