大学教授や市民オンブズマンらが腐敗防止に関心のある専門家が集まり、腐敗問題に関する意見交換の場として2000年頃から活動を始めました。2005年春、NPO法人トランスペアレンシー・ジャパンとして東京都の認証を受けました。同時に、ドイツに本部のある国際NGOトランスペアレンシー・インターナショナル(TI)本部から日本の公式チャプター(提携団体)としての認証を受けました。TIのチャプターは支部と訳すものの、本部と対等な構成員です。国連本部と加盟国のような対等な関係です。TIーJはTI本部及び海外のチャプターと連携をとりながら、腐敗防止に関するさまざまな調査・啓発活動を行っています。mission腐敗防止のために、調査研究および広報啓発活動よって腐敗に反対する世論を喚起することによって、個人および組織が腐敗防止に真剣に取り組むような一つの大きな流れを、国際NGOとして創り出すことを狙いとしています。日本における窓口として、CPI(腐敗認識指数)や各種調査の実施支援、広報を行っています。研修やシンポジウムを通じて世界の贈賄法制や国別の腐敗取締状況の公表を行っています。汚職・腐敗により、途上国では経済発展が阻害され、先進国では財の浪費・経済非効率や格差の拡大、不正、社会の閉塞が生じるため、社会システムの健全化を促す施策の提案や啓蒙・啓発活動を続けています。