正面戦闘部隊を指揮下に置く高等司令部。フォースユーザー(事態対処責任者)となり、地方総監部と共に隷下組織から兵力を提供されて海洋戦力の運用に当たる。諸外国の[[海軍中将>中将]]に相当する[[海将(乙)>将(自衛官)]]があてられているが、[[陸上自衛隊]]に於いて[[陸上総隊]]の創設が決定したことから、([[陸軍大将>大将]]にあたる)[[陸将(甲)>将(自衛官)]]を充てるであろう陸上総隊司令官と同格の地位とするため、将来的には、([[海軍大将>大将]]にあたる)[[海将(甲)>将(自衛官)]]とするものと思われる((同様に、[[航空自衛隊]]の[[航空総隊]]司令官も従来の[[空将(乙)>将(自衛官)]]から[[空将(甲)>将(自衛官)]]になるものと思われる。~創設当初は「[[旗艦]]」制度があり、司令部は[[護衛艦]]に乗っていた((当時、旗艦を務めていたのは「[[あきづき(DD-960)>秋月]]」であった。おける所轄部隊・兵員の練成を行い、フォースユーザーの要求に応じて供出できるようにしておくことが業務(以下同じ)。)))---第1〜第4護衛隊群(外洋戦闘部隊)---第11〜第15護衛隊(近海警備部隊((以前は各地方総監部の隷下にあった。)))---第1輸送隊(揚陸戦部隊)---第1海上補給隊([[兵站]]部隊)---第1海上訓練支援隊---海上訓練指導隊群--潜水艦隊---第1潜水隊群---第2潜水隊群--航空集団(基地航空隊・フォースプロバイダー)---第1・第2・第4・第5航空群([[固定翼哨戒機>対潜哨戒機]]部隊)---第21・第22航空群([[哨戒ヘリ>対潜ヘリコプター]]部隊(([[護衛艦]]に搭載される[[哨戒ヘリコプター>対潜ヘリコプター]]は本航空群隷下部隊に属しており、必要に応じて艦へ派遣される形を採っている。