IIは、少量のRNAからcDNAを合成することができるエンジニアード酵素です。cDNA合成中にRNAの分解は起きません。そのため、全長cDNAがより高い収量で得られます。加えて、酵素自体のRobust性が上がったため、熱安定性が向上しています。IIは、RT-qPCRやNGSのような複雑なアプリケーションに最適です。IIは、RNaseHドメインに変異を持ちます。そのためRNAは分解されず、より長いcDNAテンプレートができるため、結果として12kbpまでのフラグメントサイズが得られます。IIは、qPCRやNGS等のダウンストリームアプリケーションに最適です。得られた全長cDNAにより、遺伝子の全体像やスプライシングバリアントのような修飾を確認することが可能です。