GFFフォーマットのファイルで、2種類の行が含まれており、カラム#3で区別されている。tagSNP(※)を示す。kb以内であるもの)のr2を計算した。このとき解析対象としたSNPはアレル頻度5%以上に限定した。tagSNP(tagSNPの中で、他のSNPsに対するr2の平均が最も高いもの)を選んだ。2004)のldSelectプログラムをハプロイドデータを扱えるように改変して用いた。SNPの存在する染色体。