EXODUSSTORYフェストゥムに追われる人類軍輸送機救援のため、ファフナーの出撃が決まった。広登たちは気負う事なく、笑顔を見せながらファフナーに乗りこんだ。敵はスフィンクス型1体。優勢に戦闘を進めるファフナー部隊だが、経験を積んだ敵は新たな戦い方を学び、仕掛けてくる。優勢だった戦いも、やがて劣勢へと追い込まれてゆく。島のパイロットたちは見た事もない敵の戦法に戸惑う。そこへ、思いがけない増援が合流。広登たちを援護しはじめた......!。