2006-二代目FJRは2006年から。このモデルチェンジでグレード分けがAとASに。この時から既にABSが標準化されました。Shift)を搭載したモデル。YCC-Sというのはまあ要するにクラッチを電子制御することでクラッチレスになってるセミMTの事。ご覧のようにクラッチレーバーがありません。代わりにパドルシフトが加わってます。このパドルシフトでギアを上げ下げ出来るわけですね。シフトペダルもちゃんと付いてます。ハンドルでも足でもシフトチェンジが可能な。面白いのはAS(クラッチレス)モデルはシフトチェンジが"1→N→2→3...."ではなくN→1→2→3...とボトムニュートラルになってること。これは長距離走行時の疲労を少しでも和らげるためなんだって。走行中に間違ってNに入れてしまわない様に停止時以外はNに入らないようになってます。ところで何故ATではなくセミMTというのかというと、クラッチは無いけどシフトチェンジは自分でしないといけないから。三速で走ってて信号で止まったとしてもギアは三速のまま。発進する時は自分で一速に入れないといけないし、アクセルをどれだけ開けても勝手にシフトを上げたりしない。ココらへんがホンダのDCTとの違いだね。ホンダのDCTは自動でシフトチェンジをするからアッチはAT。いやDCTなんだけど。なんで自動でしないの?って話だけど、これには実にヤマハらしいというかFJRらしい理由があるそれはあくまでもFJRは"スポーツツアラー"であり"ツアラー"じゃないから。クラッチだけでなくシフトチェンジまで自動でやってくれると疲労は減るんだけど、それではファンライディングが楽しめない。シフトチェンジというバイクを操る要素を残したんだって。このYCC-S以外にもリアフレーム、ラジエーターなどに変更が加わっています。ちなみに2008年モデルからパニア別売り化で価格も下がっています。※[]内はFJR1300AS(2D2)系譜図1984年FJ1100(36Y)1986年FJ1200/A(4CC)2001年FJR1300/A(5JW/5VS)2006年FJR1300A/AS(3P6/2D2)2010年FJR1300A/AS(1CY/1DA)2013年FJR1300A/AS(1MC/1MD)2016年FJR1300A/AS(B88/B95)。