方向に、次のように行われる。変えながらこのサイクルを繰り返すことによって伸長反応を行う。きれい除去できなかったり、保護基がうまく取り外せなかったりする、などのエラーが生じる可能性がある。このようなエラーはサイクルを繰り返すたびに積み重なる。末端から離れば離れるほど、リードのクオリティスコアが低下する原因となる。1塩基合成反応)クオリティスコアの閾値の決め方クオリティスコアを利用したリードのクリーニングの際に、閾値を目的に応じて変更する必要がある。検出などが目的の場合は高めの閾値にする必要がある。閾値とする場合が多いかった)。細胞から抽出し、断片化する必要がある。出現確率が等しいと考えられる。ついても同様に考えられる。塩基が明らかにこのような傾向がみられない。以下のグラフは横軸が断片の位置、縦軸が各塩基の出現確率を表している。塩基以降では明らかに傾向が異なる。解析を行っても同様なパターンが観測される。