核酸配列データベースである。いずれかのデータベースに登録する義務がある。登録されているデータは公開され、無償で再利用が可能である。登録されているデータは冗長性がある。同じ生物種の同じ遺伝子について複数研究グループが研究している場合に、それぞれの研究グループが別々に塩基配列を登録するため、重複が生じる。番目として登録する可能性も十分にありうる。同じ遺伝子のデータが異なるアノテーションで複数登録されている場合、どれかが間違っているわけではなく、それぞれの実験目的に応じて解釈した結果、異なるアノテーションが得られたと考える方が正しい。登録されているデータを利用するとき、これら冗長性やアノテーションの曖昧性があることを十分に注意を支払う必要がある。フォーマットとよばれるルールで記述されている。文字はレコード名と呼ばれている。文字以降にどのような内容が記述されているのかを予想がつく。フォーマットのファイルに対してプログラムで処理する際に、レコード名をチェックして分岐処理を行い、必要なデータだけを取り出すといった際に役立つ。フォーマットで表示した例である。