分離された変異株は名前を付けられて管理される。名前は以下の条件の上から下へ順番に名付けられる。型(A型、B型、C型のどれか)主な宿主(例:ヒト)分離された場所(例:福建)分離された順番(例:411番)分離された年(例:2002年、下2桁のみの場合もある)亜型(例:H3N2)このようにして名付けられたA/Fujian/411/2002(H3N2)は福建(Fujian)で2002年に411番目に分離されたH3N2のA型インフルエンザウイルスであることを示している(宿主がヒトの場合は省略されるがヒト以外の場合は型の後に入れられ、A/equine/Miami/1/63(H3N8)のように表記される)。virus)に分類される。16種類のヘマグルチニン(HA)と9種類のノイラミニダーゼ(NA)の組み合わせにより様々なタイプが存在する。H16は1996年にスウェーデンとノルウェーからのユリカモメから発見され、2005年に報告された[4]。インフルエンザウイルスは同じ亜型でもしばしば突然変異を起こし、性質が変化することがある。その大部分はその後絶滅する。ある年に流行したH3N2型インフルエンザウイルスと、別の年に流行したH3N2型インフルエンザウイルスの性質は全く異なっている場合もある。