D.D.アヒルの海賊。クララ水中を上下に激しく動いている生物。ボウッストーブ谷に出現する。マリオシリーズのバブルを彷彿とさせるキャラ。ヤリクリオバケヤリクリのオバケ。後ろを向くと近付いてくる。ハリスシャーベッ島にいるハリネズミ。ハリをだして攻撃してくる。イシダルマシャーベッ島に出現する雪ダルマの海賊。氷の結晶をはきだして攻撃してくる。ガウガウブラックシュガー団いちのナイフ使い。正面にいるとナイフをとばしてくる狼男。デビデビワリオが近付くと真上から攻撃してくる小悪魔。ポコペンペンギンとタヌキが合わさったような海賊。お腹の爆弾を蹴って攻撃してくる。トゲ付きの鉄球を振り回すモグラの海賊兵。動きはデビデビと同じ。ノッコ水中でフラフラしているタツノオトシゴ。近づくと刃を回転させ襲ってくる。ワリオが下に来ると天井から急降下してくる。落ちた後は何もしてこない。チキンダックフラフラ飛んできて居眠りするトリ。頭に敵を投げ込むと10コインを3枚落として飛んでいく。ゴボテン水中でワリオを狙う狙撃兵。水中銃(モリ)が武器。ピーカンペリカンの海賊。口からバクダンをだす危険な敵。コノタコ体がバクダンになった空飛ぶタコ。吸盤でくっつきそのまま自爆してくる。ウキワニワニのくせに浮き輪を使っている。真下にくると口をあけて飛び上がってくる。正体不明のスライムのような生き物。ふむと膨らんでワリオを真上に飛ばす。『スーパーマリオブラザーズ3』に登場する同名の敵とは関係ない。トゲマル地面の上をピョンピョンはねている丸いモンスター。背中に棘が生えているが、腹は丸い。カベづたいに動いている電気のタマ。パイダンハシゴを上下しているクモの海賊。ベエ近づくと逃げる謎のハエ。前作に登場したB・フライの仲間らしい。ピッカリクンカミナリ雲。ワリオをしつこく追いかけカミナリを落としてくる。カミナリを敵に当てると10コインに変化する。ハニハニワリオの味方であるハニワ。上に乗ると矢印の方向に動く。ジャンプすることで方向が変わる。ビッグ突然上から降ってきて転がってくる巨大なリンゴ。ゴロートゲ付きの鉄球。地面に隠れているがあることをすると現れる。バットしゅるけんシロップ城に設置されているトラップ。コウモリミサイルで攻撃してくる。ヤブリキキャプテン・シロップへの部屋の入口を守るヨロイ兵。編集トゲブロスライスビーチのボス。その名の通り甲羅にトゲの付いたブロス。手足を甲羅に引っ込め、高速で往復体当たりをしてくる。天井や床の砂に潜ることもできる。ビーフンポット山のボス。ミノタウロスのような姿をしている。頻繁にジャンプして襲い掛かり、ワリオを持ち上げて部屋の左右にある溶岩めがけて投げつける。ヒンヤリシャーベッ島のボス。トゲグローブをはめており、左右に歩きながら前方にパンチを繰り出す。1回踏むと頭にトゲ帽子を載せてくる。このヒンヤリ戦の時だけ最初から出口の扉が開いている。倒しても、このボスだけは唯一復活しているため、再び訪れても戦うことになる。巨大な顔だけのボスで、常に空中に浮いている。鼻から燃え上がった岩を出し、舌で足場を崩して攻撃してくる。ティーカップ号のボス。殆ど動かず、翼の強風と、口から出す3匹のザコで攻撃してくる。強風攻撃はかなり強く、同時に飛んでくるザコの攻撃をかわさなければならない。ちなみに、次作にもボスとして出てくる。ゼニスキーパセリの森のボス。首から財布(がま口)を下げている。体当たりと、財布からコインを投げつけてくるが、コインはすぐお化けヤリクリオバケに変化する。体当たりを喰らうと、しばらくしびれて動けなくなる。キャプテン・シロップブラックシュガー団のボスである女海賊。部屋には自分の大きな肖像画を飾っている。本人は戦わず、ランプの精デンプーを従えている。『ワリオランド2』や『ワリオランドシェイク』にも登場する。デンプーシロップ城のボス。空中を左右に飛び、指からエネルギー弾(着地すると高速でワリオに向かってくる)で攻撃してくる。ランプを転がすと雲が出てリフトになるが、一定時間経つと雲が子デンプーに変わって攻撃してくる。『スーパーマリオ64DS』もこの節で扱う。場所で空から降ってくる(特定の大砲から打ち出されていることもある)。地面に落ちると数回バウンドしたあと自滅する。特定の場所を往復していたり、坂道を転がってきたりする。場所によっては壁に衝突して自滅することもある。ツキダシドン突き出す直方体の岩。一定時間ごとにマリオを落とそうとする。沈没船の入り口から出てくる。近づくと噛み付こうする。触れるとダメージを受ける。勝手に閉じたり開いたりする貝。中には赤コイン、またはノコノコの甲羅(掴むと水中で滑り始める)が入っている。当たるとダメージを受ける。さん頭に花びらのある浮遊する敵。移動速度は遅く、体当たり以外攻撃はしてこない。踏みつけると少しの間くるくる回りながら滑空できる。マリオを見つけると飛び掛ってくる。アイクン眼球のような形をしている敵。マリオがいる方向に目を向け、マリオがアイクンの近くでしばらく動かないと、一度まばたきをした後に目から光線を放ってくる。キラーピアノ牙の生えたピアノ。近くを通ると突然襲い掛かってくる。キラーブック突然本棚から飛び出してくる本のお化け。近づくと飛んでくる椅子のお化け。飛んできたあと消滅する。どんけつ角の生えた黒い玉。マリオに向かって突進し、溶岩に突き落とそうとする。触れてもダメージは受けない。頭上のプロペラで浮遊しているヘイホー。オニマスクン砂漠の狭い通路を大きな音を立てて転がる巨大な金属の箱。6面あり、笑い顔×2面、泣き顔×2面、怒り顔×1面、残り1面はくぼんでいる。ジャンゴいたずら好きのハゲタカ。パワースターを持っていたり、マリオの帽子を盗んだりする。64版ではあっちっち砂漠のみの登場だったが、DS版では他のステージにも登場し、ヨッシーにも突進してくる。グル砂漠のピラミッド内に1匹だけ存在する八角柱の石。転がりながら通路をうろついている。近づくと押しつぶされる。カク砂漠のピラミッド内に登場。ドッスンと似た性質を持ち、その場で上下するタイプと上下しながら一定の場所を往復するタイプがある。クロマメ(DS版ではケロンパ)小さな黒い玉。マリオが近づくと膨らみ、炎を吐いてくる。吐いてきた炎は少し時間が経つと消える。