0.01-0.02にするまた、実際に変数をどのように設定するかは「いくつかのパターンで実行してみて、より良い結果を出すものを探すべし(意訳)」とのことです。artefactで生じた)キメラのリードを除く。ゲノムの「コンセンサス配列」を作成するここでblasrとSparcが必要になります。blasrおよびSparcのインストールについては前のエントリを参照して下さい。Sparcのプログラムおよびいくつかのスクリプトを、解析を行うディレクトリにコピーするコピーでもシンボリックリンクでもいいですが、Sparcフォルダの中にある以下のものを解析を行うディレクトリに置きます。シェルスクリプトsplit_and_run_sparc.shを実行する以下のコマンドを実行して、解析開始です。Consensus配列の結果は、"results"というフォルダ内にできます。format)3と4を合体したのが"ctg_pb.fasta"になります。Groupを付ける(GATKへの対応)以下は個人的なメモ(覚え書き)になります。(4)月別アーカイブはてなブログをはじめよう!hashiyukiさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。