ToolsFASTA形式の塩基配列(アミノ酸配列)ファイルをNEXUS形式やPHYLIP形式に変換したい、ということはよくあります。単一のファイルならClustalwやMacCladeを使用して変換できますが、多数のFASTAファイルを扱う場合(数百〜数千遺伝子を用いた系統解析など)、一括でファイル形式を変換するスクリプトがあれば便利です。PHYLIP形式へ変換するPerlスクリプトを公開します。アラインメント自体は行わないので、すでにアラインメントされたFASTA形式ファイルのみが対象になります。配列名は9文字まで、という制約があります。scriptを使用して下さい。phy_filesdoneファイル形式の変換、一般的に、FASTAから別の形式への変換を行うことは多いですが、逆のパターンは少ない気がします。fileの作成(Tr...以下のエントリーの続きです(じつに96日ぶり!)。(4)月別アーカイブはてなブログをはじめよう!hashiyukiさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。