マイクロアレイに関してはたくさんの手法が提案されていて、いくつか読んでみました。changeの大きさで遺伝子をランク付けし、DEGを選び出すノンパラメトリック手法。すごいシンプルで面白いです。testによって判断する。Rのパッケージもあります。理由は理解できていないのですが、等分散を仮定しているようです。ばらつきの大きいデータでt検定との検出力の比較をおこなっているのがこの論文。この手法だと、発現量の絶対値が低い遺伝子もDEGとして選択されますね。changeをベースにDEGを選ぶ手法です。changeを基準に遺伝子を選ぶという手法。シンプルで面白いです。Productと同様におこなえば計算できそう。RP法やt検定ベースの手法との比較論文も。changeが小さくとも有意差が出るので実感と合わない結果が得られるんですね。testというのを勉強中。仮定さえ合えばパラメトリックな手法を使用したいので。なんでも全遺伝子のばらつきをプールしてt検定をおこなう方法のようですが。DEG解析など前回の続き。(9)月別アーカイブ注目記事はてなブログをはじめよう!Kyoshiro1225さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。