手法は多くあり、それぞれに利点があります。異なる最大のポイントは、CAGE-seqがゲノムワイドに転写開始点を正確に同定できる点にあります。CAGE-seqでは、プロモーター領域の詳細な解析ができるため、特定遺伝子の発現制御に関与したプロモーターごとに分けて解析することが可能となり、転写のシグナル伝達のカスケードを明らかにするなど、新しい視点に立ったゲノムアノテーションが可能になります。site)を網羅的に解析する方法です。その特徴は、RNAの5’末端に付加されるキャップ構造を特異的にビオチン化して回収するところにあります(Cap-trap法)。PCRによる増幅工程をライブラリー作製過程から完全に排除することにより、CAGE-seqは、他の方法よりも定量性に優れ、広いダイナミックレンジを有しています。promoterの探索、高度な遺伝子制御ネットワークの推定など、CAGE-seqの結果からは多くの情報を得ることができます。ファイルサイズが32.6GBになるためダウンロードに時間がかかります。polII産物の5'キャップ構造を化学的にビオチン化します。ビオチン化されたRNA-cDNA二本鎖をストレプトアビジンビーズで回収することで、混在している断片化されていたRNAやrRNA由来のRNA-cDNA二本鎖は除去されます。この後、RNaseH処理によりRNAを分解し、得られた一本鎖cDNAに5’リンカーおよび3’リンカーを特異的に付加します。最後に第2鎖を合成すれば、イルミナ社のNGSに適応したライブラリーが完成します。以下をはじめとする組織で幅広く利用されています。国内への納品の場合は、送料は発生しません。CAGEライブラリー/解析結果HDDは、平日に到着するように発送致しますが、不測の事態が起きた場合には、休日に到着する可能性があることをご了承下さい。大量にご注文の際は発送方法が変更になる場合がございます。(1996)閉じる見積を依頼する。