【司令部】受けられるミッションを増やす。戦闘PTに加えられる怪人たち。新しい種類の怪人を使いたくなったらこれ。装備や戦闘中アイテムなんかの開発に関わる。【諜報部】色々なことが起こせるようになるが、その中にスケベなことも多分に含まれる。【医療部】BL団にはストレス値が設定されており主に闇子が部下を慰安(意味深)することで下げられる。その時の効果な気がする。(投げやり)上記を駆使してPTを揃えたらミッションを受け街に出て戦闘開始。本作はFF13を彷彿とさせるヘイト管理に焦点をおいた戦闘バランスとなっている。本作にはロールが3種類あり、各キャラにそれぞれ割り当てられている。内訳は【アタッカー】【タンク】【ヒーラー】。本作は戦闘時、相手の次の行動と誰を狙っているかが逐一表示される。これを巧みにコントロールするのが本作の戦闘のカギ。ヒーラーが回復魔法を使ったり、アタッカーがとても高いダメージを与えたりすると例えターン中だろうと敵のターゲットはヘイトを集めたものに変更される。これに対抗する切り札がタンク。タンクは挑発を始めとした超強力なヘイト管理スキルを次々に習得していき素のステータスも耐久が非常に高い。基本に則ってこれらコントロールを意識できるようになろう。(ポンコツな筆者はよく適当に連打して痛い目を見る)またコンボ用の状態異常もいくつか用意されており、油状態の敵に火属性、水浸し状態の敵に電気属性などで火力が飛躍的に向上するなどの戦略性も。ボスは上記を自在に操れなければそう簡単には乗り越えられない。本作の戦闘用の消耗品は使い捨てではなく一度開発さえしてしまえば1戦闘につき規定の回数だけ使える。それに伴い買い物の概念もなくシステムとしてのショップも存在していない。買い出し無いのは楽ちん。ちなみにミッションには非戦闘も多く用意してある。装備生産の素材を集めるものは最優先で。オープニング前に難易度選択機能でイージーかノーマルから選べるので最悪下げてもHシーンは全て埋められる。マップのアクセス性についてもよく考えられてある。ストーリー進行で徐々に各ショートカットが開放されていき、ほぼ全域にショトカ可能に。周回で施設を各駅に繋ぐアイテム開放。(なお駅側の出入り口は・・・)一見細い道で入り組んだ街も細かい横道で詰まること無く抜けられるようになっている。