(図をクリックすると拡大します)ホモ接合性挿入検出の例。(図をクリックすると拡大します)ホモ接合性重複検出の例。Surveyorではマルチステップアライメントとサンプルトレースのデコンボリューションによりヘテロ接合性Indelを自動検出することが可能です。Detectionツールが開き、サンプルトレースをリファレンスにマッチするアレル波形とそれ以外のアレル波形を確認できます。リファレンスにマッチしないアレル波形はそれのみで再度リファレンスにアライメントされヘテロ接合Indelの正確な位置を特定します。Detectionツールはトレース中の任意の領域に使用することも可能です。ヘテロ接合性Indel検出の例。(図をクリックすると拡大します)ヘテロ接合性Indel検出の例。各アレル波形が重なっているためヘテロ接合Indelイベント検出位置以降ではアライメント不能になります。Region(図中の青い縦線で挟まれた領域。ライトブルーでマークした範囲)は必ずヘテロ接合挿入・欠失の位置で止まります。SurveyorにはMutationプロジェクトの情報詳細を表す様々なグラフィカルベースやテキストベースのレポートやカスタマイズ可能なレポートがあります。これらのレポートは全て、GADの一部または全ての情報についてレポート形式で出力します。メインメニューのDisplayメニューから使用できます。これらのレポートは全て、Mutationプロジェクトデータについての重要な情報を表すのにカラフルな凡例を使用しています。これらのレポートはプリントアウトやPDF、Excel、テキスト、画像形式で保存が可能です。グラフィカルレポート。ベースパッチ機能によりベースラインノイズを減じたり、ピークをシャープにしたり、シーケンストレースのモビリティシフトにおける問題を補正したりすることが可能です。5.0から第二世代DNAシーケンサーデータ統合解析ソフトウェアNextGENe(ネクストジーン)と共通に使用できるバリアントナレッジデータベースを搭載しました。このデータベースにより、dbSNPやdbNSFP、COSMICなどバリアントデータベース由来情報による検索や、擬陽性やアーチファクトなど手動で削除したバリアントをカスタムナレッジベースへ登録することができるようになりました。Surveyorによるバリデーション結果をNextGENeで使用できます。Tracksマネージャを使用する際は64bitOS、12GBのRAMが必要です。dbSNPやdbNSFPなど大きなトラックをロードする場合は100GBのHDD空き容量が必要です。​ユーザーマネジメントシステムとオーディットトレイルユーザーマネージメントシステムでは、管理者によるユーザーパスワード設定や各アクセス権設定が可能です。各ユーザーのアクセス権は管理者によってのみ決定され、権限のないユーザーが不慮にプロジェクトを変更したり、設定済みの解析パラメーターを変えてしまったりすることを防げます。ユーザーマネージメントシステムの搭載により、研究室内の多くの人がソフトウェアを使用することにより生じる不具合や混乱が解消され、快適かつ効率的な解析が可能になります。解析プロジェクトのバリアントコール編集などの履歴がユーザーとともに記録されます。ユーザーマネジメントシステム設定。ユーザーをグループに分け、グループごとに機能へのアクセス権設定が行えます。プロジェクト内のバリアント編集等の記録がユーザー名や日時とともに記録され、編集前後の値を確認できます。自動解析ツールは、さまざまなシーケンスプロジェクトのバッチ処理が可能です。この機能により所定の時間間隔で多くの解析を無人で実行できます。ジョブファイルは、プロジェクト設定やサンプルトレースファイル、リファレンストレースファイルの指定、解析レポート設定などが可能です。SurveyorソフトウェアはミトコンドリアDNA解析にも対応しています。ミトコンドリアDNAのGenBankファイルをロードすると、GenBankファイルのタグを認識し自動的にミトコンドリアDNAの遺伝コードを採用。環状ゲノムの開始点/終始点を自動的に認識して、正確にアノテーションを行います。Surveyorは、バイサルファイト処理シーケンスのDNAメチル化解析にも対応しています。Editorツールによりリファレンス用配列へと変換後、変換した塩基配列を元にリファレンス波形ファイルを自動合成します。この合成リファレンス波形ファイルとサンプル波形ファイルをアンチコリレーションテクノロジーによって比較しメチル化サイトを検出します。Displayで出力可能です。:info@bio-upload.comバイオアップロードは創業以来、開発元のSoftGenetics社と同様にプラットフォームに関わらず、独立した立場からSoftGenetics社製品の販売とサポートを行っています。バイオアップロードはSoftGenetics社製の全ソフトウェアを販売する唯一の日本正規代理店です。頼フリートライアルお問い合わせ。