5333)2種類のヒト由来細胞株を用いてMLH1遺伝子上流域のヌクレオソーム局在化と同遺伝子の発現を解析することで、遺伝子上流域におけるヌクレオソームの局在化が遺伝子発現に及ぼす影響を解析した。μlで溶出;ヌクレオソームDNA)。使用してリアルタイムPCRを行い、MLH1上流領域のヌクレオソーム存在位置を解析した。解析に用いたリアルタイムPCR用プライマーは、MLH1遺伝子上流域をTiling状(図1、領域a~f)に検出するように設計した。RR820Aの旧バージョン)によるリアルタイムPCRで解析した。Timeサポートシステムにより設計・合成したものを利用した。Quantity=1)として表した(図2.)。Primerにより得られた値で補正した。この結果、ヌクレオソームDNA中に含まれるゲノムDNA領域a~fの相対量は、SW48細胞では高く、HeLa細胞では低くなった。これらの結果から、SW48細胞ではMLH1遺伝子上流領域にヌクレオソームが密集し(ヘテロクロマチン)、一方、HeLa細胞ではこの領域にヌクレオソームは散在的に存在している(ユークロマチン)ことが示唆された。SW48細胞におけるMLH1遺伝子mRNA発現量を、HeLa細胞におけるmRNA発現量の相対値として表したところ(図3)、HeLa細胞でMLH1遺伝子mRNA発現量が高く、SW48細胞で低いことが確認された。以上の結果より、MLH1遺伝子mRNA発現は、MLH1遺伝子上流領域におけるヌクレオソーム局在化が一因となり調節されていることが示唆された。