Achievements概要:次世代シーケンサー(NGS)を効率的に用いて転写サイクルの解明に資するゲノムアッセイを行うことを目的に,以下の項目で研究を進めた。Protonの稼働率向上に向けて:P2チップの登場を期待していたが、結果的には販売されず、これまでと同程度の出力に留まったため平成27年度と同様の使用量となった。RNA-seq解析系の確立:RNA-seqについては、遺伝子変異の結果生じるトランスクリプト異常を鋭敏に検出するインフォーマティクス解析系を検討した。その結果STARを用いた解析で遺伝子異常によるトランスクリプト異常を高い検出感度で同定することが可能であった。転写サイクルに関わる遺伝子異常による疾患の解明:転写サイクル異常に関わる疾患として解明を進めているCoffin-Siris症候群はBAF複合体の5つのサブユニットをコードする遺伝子とBAF複合体の下流に位置する転写因子SOX11の点変異で惹起されることを解明することができた。この6つの遺伝子の中でARID1Bのみ欠失やtruncation変異を認めた。それ以外の5つの遺伝子ではいずれもミスセンス変異を呈した。このことはBAF複合体の各サブユニットがそれぞれのタンパク量を最適化して複合体として調和を保って微細な転写調節を行っている可能性を示唆していると考えている。Status28年度が最終年度であるため、記入しない。Activity28年度が最終年度であるため、記入しない。