2年生になった時点で「進学科」と「専攻科」を選択するようになっており、専攻科を選んだ場合、その分野での就職がほぼ約束されている。部活動が100以上乱立しているため、自治生徒会が主体となって管理・運営している。ちなみにアルバイトは原則として禁止している。学園の情報は主にインターネットでの高藤学園HPの掲示板でリアルタイムで更新され、選挙期間内の候補者の支持率も確認できる。言えば「生徒会」なのだが、メガ学園である高藤学園においては1つの組織だけでは運営しきれないため、主に行政3部に別れて運営している。