えいいかだいがっこう将来の医師たる幹部自衛官を育成するための機関。1973年防衛庁の施設等機関として開設され,1974年医学科学生の教育を開始。1987年医学研究科学生の教育開始。1996年防衛医学研究センター開設。医学科では,学校教育法に基づき医学教育を行なう大学の設置基準に準拠して教育が実施され,修業年限は6年。相当する教育を施し,修業年限は4年。学生は防衛省の職員,特別職の国家公務員として扱われる。