ExtensionsCOOTの隠れた(?)便利機能満載のExtensionsメニューを使ってみます。この辺はおそらくバージョンごとにかなり異なっていると思うので注意してください。対象となるバージョンは0.5.2です。ここで解説してある他にもまだまだ機能はあります。試してみると幸せになれるかも(不幸なときもある・・・)。分子置換後の自動精密化コマンドです。0.5.2からはExtensionsが項目にわかれるようになったのでPostMRという分類が作成されました。それまでのバージョンではコマンド名に[PostMR]とついています。mapで選択した後実行します。開始すると位置残基ずつフィッティング実行されます。スタートしてしまうと完了するまで停止できないので注意!自動で全部の残基のフィッティングを行うためそこそこきれいな電子密度が求められます。主鎖が大きくずれてるとあまりよくない結果になるかもしれません。Plotをしています。R値が微妙に落ちにくい時(30%前後)にはコンポジットオミットマップを基にして同様のことをしたら多少(1-2%程度)、値が下がりました。試してみたくるくると電子密度を回しながらRotamerを当てはめていく様子は見ていて楽しいのですが、結構ぐちゃぐちゃになります。REFMACを流しても改善されませんが、CNSなら多少補正されました。ラマチャンドランプロットが相当崩れましたのできれいな電子密度を使わないとダメな気がします。使いものになるかどうかは・・・微妙。