「アルファード」「ヴェルファイア」の原動機(エンジン制御用コンピュータ)に不具合があり、アイドリングストップ後にエンジンが再始動できなくなる恐れがあるとして、国土交通省にリコールを届け出た。エンジン制御用コンピュータで、充電制御プログラムが不適切なため、長時間のアイドリングを頻繁に繰り返すとバッテリが異常劣化することがある。そのため、アイドリングストップ後、エンジンが再始動できなくなる恐れがある。これまでに不具合が27件、事故はない。