伴い、JR埼京線とりんかい線の相互直通運転を開始。りんかい線でも「Suica」の利用が可能となる。(営団地下鉄)民営化に伴い、有楽町線の駅は東京地下鉄(東京メトロ)に継承される。10月16日:JRのダイヤ改正に伴い、京葉線の通勤快速が停車を開始。2007年(平成19年)3月18日:東京メトロでICカード「PASMO」の利用が可能となる。3月24日:京葉線ホームに発車メロディを導入。臨時特急列車「ベイリゾート」号の運転を開始。2011年(平成23年)9月24日:この日をもって「ベイリゾート」号の運転を休止。2013年(平成25年)6月29日:有楽町線ホームでホームドアの使用を開始[4]。同時に接近メロディも使用開始した[5]。駅構造編集JR京葉線ホームが4階、コンコースが3階、東京メトロ有楽町線ホームと東京臨海高速鉄道りんかい線ホームが2階にある。1階部分に当たる高架下には飲食店が軒を連ねている。りんかい線は、コミックマーケットをはじめとする年に数回開催される沿線でのイベントに対応するため、混雑時に備えて改札横に臨時出札窓口を数箇所設けている。島式ホーム1面2線を持つ高架駅。改札階とホームを連絡する階段は2か所あるが、朝のラッシュ時には不足気味で、改札を抜けるまでに時間がかかることもある。通勤快速は当駅を通過していた。東京駅間の開業後は使用停止扱いとされ、当駅での折り返しは不可能となった。2006年9月28日に発生した東京駅機器室の火災事故に伴い、連動装置を整備し、折り返し機能を復活させた。以後は異常時対応用として、常時使用可能な状態を維持している。蘇我寄りにはりんかい線との連絡線がある。全線開業前は70-000形電車が検査などのために京葉電車区(現・京葉車両センター)や蘇我経由で大井工場(現・東京総合車両センター)へ自力回送していたり、団体臨時列車が運行されたこともあるが、定期列車が運行されたことは一度もない。これについてはりんかい線との関係も参照のこと。有楽町線への乗り換え客も多く、それまで通過していた京葉線の通勤快速の停車を求める乗客の要望があったため、2004年(平成16年)10月16日のダイヤ改正より停車となっている。特急列車が定期的に停車したことはないが、金曜夜の「さざなみ」と土曜・休日の「わかしお」を中心に期間を限定して当駅に臨時停車した実績がある。2009年(平成21年)には3月6日から6月26日(3月20日を除く)までの毎週金曜日および3月19日に「さざなみ21号」が臨時停車していた。主本線を発着する場合は通過が可能。発車メロディ編集2007年3月24日からテイチク制作の発車メロディを使用している。島式ホーム1面2線を有する高架駅。ホームの東側に新木場車両基地があり、ここに通じる線路が留置線として利用されている。渡り線は留置線側にあるため、1番線の列車の入庫および2番線の列車の進入はほぼ同時に行われる。新木場地域」として近隣の駅を管理している[7]。メトロ線改札口(2008年2月)ホーム(2016年6月)発車メロディ編集2番線のみ、2013年6月29日からスイッチ制作の発車メロディ(発車サイン音)を使用している。島式ホーム1面2線を有する高架駅。前記したように、JR京葉線の間に連絡線がある。朝夕に主に通勤・通学客で混雑し、休日は主に東京ディズニーリゾートや葛西臨海公園、お台場などへ向かう行楽客で賑わう。幕張メッセや東京ビッグサイトでのイベント開催時にも混雑することがあり、日によって乗降人員に変動がある。