http://biokids.org/a6e108.html各種プログラム使用方法HKL2000のログデータ処理で使用するHKL2000。これは結局のところDENZOとSCALEPACKのインタフェースです。そのためそれぞれのログファイルが存在します。その中で必要な情報を集めてみましょう。)SCALEPACK論文でデータ処理の統計値を載せるときにはこのログファイルを確認します。ファイル自体は大きくなってますが、統計情報だけならそんなにありません(たぶん)。HKL2000のディフォルトのファイル名はscale.logです。fittedがずらーっと並んだ後半部分を見ていきます。scalingスケーリングに使用された反射数です。0.104フレームごとの反射数とR値が並んでいる部分の末尾を見ます。1の値が求める値になります。この場合、132,869です。reflectionsユニークな反射の数です。shellsのテーブルで確認できます。59315このテーブルのtotalのカラムの合計値、59,315がそれにあたります。各分解能ごとの値はそれぞれの行に出力されています。(Redundancy)反射のredundancyを読みます。Shellの値を読みます。2.4各分解能ごとの値があり、全体の値(2.4)が出力されています。redundanciesのテーブルを参照します。ここには各分解能のcompletenessと全体の値が出力されています。shell(2.38-2.30Å)では88.0%となっています。R-mergeログファイルのほぼ末尾にあります。処理する際にどこまでの反射を使うかを決める目安にもしていると思います。この場合10.4%ですね。消滅則ログの最後に消滅則に合致しているかを確認するためのテーブルがあります。0.5このテーブルで消滅則を確認します。コメントFushinobu先生からのご指摘:全体の反射数の参照先が違うのでは?とのこと。調査しますのでしばしお時間くださいませ。