この頃から物心両面の苦悩のうちに参禅の経験を重ねる。学習院の教授などを務める。京都帝国大学の助教授・教授となり、倫理学や宗教学を講ずる。唯一の実在としてそれを自己の根本的立場とする。東洋的精神性の自覚を基礎に、西洋哲学を積極的に摂取し、東西思想の内面的統一を求めて、独特の「西田哲学」を樹立し、田辺元らと京都学派を形成する。1928年(昭和3年)退官後も活発な著作活動を続け、大正・昭和時代の哲学思想に大きな影響を与える。