プログラミングPythonでファイルの読み込みや書き込みをする際にはopen関数を使うのが基本ですが、下に挙げるような少し複雑な操作をしたい場合には頭を抱えることになります。標準入力からも読み込みたい、ただし指定したときにはファイルからも読み込んでほしい。Pythonオーソログ推定プログラムのOrthoFinderですが、便利なことにオーソログ推定の結果予測されたシングルコピー遺伝子の情報を個別に抽出してディレクトリにまとめてくれます。プログラミングPythonスクリプト内で外部プログラムを呼び出して解析を実行することが多々あるのですが、プログラムの中には出力先を指定するオプションがなくカレントディレクトリに結果を出力することを想定しているものがあります。LTSにしてから、exitで端末を閉じようとするとフリーズするようになってしまいました。プログラミングpythonでディレクトリ(フォルダ)下のファイルを一括で変更して通し番号を振るスクリプトを作ったので備忘録を兼ねてまとめます。※この記事は1巻発売時に作成したものです。ネタバレが多少ありますのでご注意ください。バイオインフォマティクス複数のNewick形式の系統樹から樹形が同じものを抽出する必要に駆られたので備忘録を兼ねたまとめです。デスクトップ環境この度VimからNeovimに乗り換えたので、備忘録を兼ねてそのインストール手順をまとめます。雑記どうにもパソコンの動作がモッサリとしていたので軽くする方法を調べてみました。した試みは徒労に終わる傾向が強いような印象があったのですが、珍しく満足するレベルで高速化できましたので備忘録を兼ねてまとめます。デスクトップ環境rangerはターミナルから起動できるvimライクなキーバインドで操作できるCUIのファイラーです。ターミナル内で使えるファイラーは他にも試したのですが操作が良く分からず、デフォルトの状態でも十分使いやすいrangerに落ち着きました。マンガ別ページの百合作品一覧表から、容量の都合で百合漫画の短編・中編集だけ移動させることにしました。何となくこちらは作者名別に50音順で並べています。独断と偏見で選んでいますので正確性に関してはお察しください。未読の作品もあるため、特に短期...百合漫画(短編集)一覧表2019-02-02ブログが月間3000PVを突破したので一応分析してみる雑記あまりブログの運営に関する記事は作らずに淡々と続けていこうかなと思っていたんですが、やっぱり嬉しかったですしまあ良いかなーってことでダラダラと書き綴ってみます。ブログ4ヶ月目にしてついに、1ヶ月のPVが3000を超えましたー。※ネタバレが多少ありますのでご注意下さい。」のレビューもとい感想です。※この記事は1巻発売時に作成したものです。多少のネタバレがあります。舞台は魔法世界のとある国の孤児院。Girl」のレビューもとい感想です。読んでいると何だか心がふにゃふにゃしてくる可愛さたっぷりの一冊です。バイオインフォマティクスBiopythonを使って、与えられたFASTAファイルの配列データをクエリーとしてオンラインのBLASTを実行するスクリプトを作成したので、備忘録を兼ねてまとめます。公式のチュートリアルを参考に作りましたので詳しくはそちらをご覧ください。バイオインフォマティクス解析に使うプログラムの中には、FASTA形式の配列ファイルではなくPhylip形式のものを要求するものがあります。今回はそのような事情でFASTA形式のデータをPhylip形式に変換する、ちょっとしたスクリプトを書いたので備忘録を兼ねてまとめます。「伊藤ハチ」先生作の百合漫画「チヨちゃんの嫁入り」のレビューもとい感想です。ネタバレ多少ありますのでご注意ください。※この記事は1巻発売時に作成したものです。ネタバレが多少ありますのでご注意ください。Python入門書で読んだきり忘れていた問題に、この度出くわしたので備忘録を兼ねてまとめておこうと思います。以下のようなPythonのコードを書いていました。※この記事は1巻発売時に作成したものです。ネタバレが多少ありますのでご注意ください。恋愛漫画を描く漫画家とそれを支える編集の物語。バイオインフォマティクス与えられた配列ファイルをプログラムで処理する際に、ファイルのフォーマットを調べておきたいという場合がたまにあります。拡張子で識別するのが簡単で手っ取り早いですが、FASTAファイルのようによく使われる拡張子が複数種類あるものだと、識別が若干面倒...Biopythonで入力ファイルがFASTA形式か調べる2019-01-08「親がうるさいので後輩(♀)と偽装結婚してみた。他者に関心を持たず淡々と仕事をこなしながら生活する社会...「親がうるさいので後輩(♀)と偽装結婚してみた。「シギサワカヤ」様作の百合漫画「君だけが光」のレビューもとい感想です。ネタバレあるかもしれないのでご注意ください。※この記事は1巻発売時に作成したものです。」のレビューもとい感想です。この記事は1巻発売時に作成したものです。寺野先生は付き合っている」のレビューもとい感想です。ネタバレあるかもしれないのでご注意ください。次のページプロフィール取り留めのないブログですがお役に立てれば幸いです。(7)月別アーカイブスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。