1年だった男子生徒が2015年11月5日に自殺した事案をめぐり、市の第三者委員会は12月9日、「担任教諭の不適切な指導が自殺の一因」と指摘する報告書をまとめた。報道によると、担任教諭がこの生徒を「いじめ加害者」と誤認して指導をおこなったこと、背景には担任教諭の普段からの「体罰」を含めた高圧的な指導があったことなどが指摘されている。報道の内容を総合すると、経過はおおよそ以下の通りになっているようである。2015年11月2日、この生徒の同級生が学校を欠席し、その際に母親から「嫌がらせを受けているので学校に行きたくないと訴えている」と連絡があった。これを受けた担任教諭は、11月4日に同級生に対し「嫌なことをされたなら、具体的な内容をこの紙に書いて提出するように」と指示した。同級生は複数の生徒の行為をあげ、この男子生徒については「方言で何か言ってきた」と記した。担任教諭は、同級生が書いた文書の内容から、自殺した生徒を含む生徒5人が同級生へのいじめに関与したと思い込んで、11月4日に5人を呼び出して指導をおこなった。担任教諭から「同級生にしたことを紙に書け」と迫られた男子生徒には心当たりはなく、「(その同級生が)自慢話の時、『だから何?』と言った。話を最後まで真剣に聞けていなかった」というやりとりのことだったのではないかと答えた。同級生がこの男子生徒について「方言を言ってくる」と訴えたことについては、同級生は「方言の意味が理解できず、悪口を言われたと勘違いしていた」として、男子生徒と和解していた。担任教諭は「(同級生が不登校になったら)責任取れるのか」などと迫った。男子生徒は教師の指導について「意味がわからない」などと別の同級生に漏らしていた。生徒の帰宅後の同日午後6時頃、担任教諭は事前の連絡なしに生徒宅を家庭訪問し、「誰にでも失敗はあることなので、改善できればいい」と告げた。両親は不在で、祖母が応対したという。生徒も同席し、涙を流していた。担任教諭が家庭訪問を終えた直後の同日午後6時55分頃、この生徒が自室で首を吊っているのを、帰宅した母親が発見した。「こうして罪を償うことを決めた」などと記した遺書が残されていた。第三者委員会では、担任教諭の行為について「同級生から十分に話を聞かずに対応した。男子生徒側にも十分に話を聞かずに、いじめがあったと思い込んで対応した」と指摘し、不適切だと認定した。当日の対応についても、学校組織としての対応ではなく、担任教諭1人の判断でおこなっていたことも指摘された。練習でミスをした女子生徒にボールをぶつける」「たばこの吸い殻の入ったコーヒー缶を顔付近めがけて投げつける」などの行為が日常的にあったことが、複数の生徒の証言から明らかになった。当日の指導の際も、別の同級生に平手打ちを加えていたことも指摘された。自殺した生徒も担任教諭について、自殺約1ヶ月前の2015年10月に「意味の分からないところで怒る。目を見るのが怖い」などと家族に訴えていたという。学校や市教委の不適切対応また奄美市教委は、生徒の自殺を受けて実施した臨時の校長研修会で「いじめた側の子が責任を感じて自殺した」などと話したとされる。第三者委員会の設置を申し入れた両親に対して校長が「全部公になる。